Izpis gradiva

A+ | A- | | SLO | ENG

Naslov: High-throughput sequencing in forest health surveillance : opportunities and challenges Avtorji: ID Devetak, Zina (Avtor) ID Piškur, Barbara (Avtor) Datoteke: PDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,86 MB) MD5: 4C076BA0762059B5A76461DEAF543E4E   Jezik: Slovenski jezik Tipologija: 1.01 - Izvirni znanstveni članek Organizacija: SciVie - Gozdarski inštitut Slovenije Povzetek: Redna fitosanitarna kontrola na mejah ter programi preiskav postajajo čedalje pomembnejši pri detekciji novih škodljivcev in povzročiteljev bolezni drevja. Kot eno izmed orodij za podporo vizualnim pregledom, morfološkim metodam identifikacije in tarčnim molekularnim metodam je tudi visokozmogljivo sekvenciranje. Uporablja se lahko na različnih tipih vzorcev ter omogoča simultano iskanje različnih taksonomskih skupin ter analizo velikega števila vzorcev hkrati. Visokozmogljivo sekvenciranje zahteva številne zaporedne korake, tako priprave na sekvenciranje kot bioinformacijsko zahtevne analize rezultatov. Koraki morajo biti optimizirani in skrbno dokumentirani, da lahko zmanjšamo in nadzorujemo vpliv, ki ga imajo na rezultat analize. Rezultate je prav tako treba skrbno tolmačiti ter v primeru detekcije vrste, ki ima karantenski značaj, tudi potrditi z alternativno metodo. V članku razpravljamo o uporabnosti visokozmogljivega sekvenciranja v okviru varovanja gozdov ter premišljujemo o različnih vrstah vzorcev, tehničnih vidikih ter možni sinergiji z že uveljavljenimi metodami. Ključne besede: zdravje gozda, meta analiza črtnih kod, škodljivci, glive povzročiteljice bolezni, visokozmogljivo sekvenciranje Status publikacije: Objavljeno Verzija publikacije: Objavljena publikacija Datum objave: 19.06.2026 Leto izida: 2026 Št. strani: str. 49-62 Številčenje: Vol. 139 PID: 20.500.12556/DiRROS-30319  UDK: 630*41(045)=111 ISSN pri članku: 2335-3112 DOI: 10.20315/ASetL.139.4  COBISS.SI-ID: 282263043  Datum objave v DiRROS: 19.06.2026 Število ogledov: 33 Število prenosov: 8 Metapodatki:    Citiraj gradivo Navadno besedilo BibTeX EndNote XML EndNote/Refer RIS ABNT ACM Ref AMA APA Chicago 17th Author-Date Harvard IEEE ISO 690 MLA Vancouver : Kopiraj citat

Objavi na: Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:	Acta Silvae et Ligni
Založnik:	Gozdarski inštitut Slovenije, založba Silva Slovenica, Biotehniška fakulteta, Oddelek za gozdarstvo in obnovljive gozdne vire, Biotehniška fakulteta, Oddelek za lesarstvo
ISSN:	2335-3112
COBISS.SI-ID:	266761216

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:	ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:	P4-0107-2020
Naslov:	Gozdna biologija, ekologija in tehnologija

---

Financer:	Drugi - Drug financer ali več financerjev
Številka projekta:	UVHVVR
Naslov:	Uprava za varno hrano, veterinarstvo in varstvo rastlin
Akronim:	UVHVVR

Licence

Licenca:	CC BY-SA 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Deljenje pod enakimi pogoji 4.0 Mednarodna
Povezava:	http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/deed.sl
Opis:	Ta licenca Creative Commons je zelo podobna običajni licenci Priznanje avtorstva, vendar zahteva, da so materialne avtorske pravice na izpeljanih delih upravljane z enako licenco.

Sekundarni jezik

Jezik:	Angleški jezik
Naslov:	Visokozmogljivo sekvenciranje pri spremljanju zdravja gozdov : priložnosti in izzivi
Povzetek:	Regular phytosanitary border control and local surveillance are increasingly important for the early detection of novel plant pests and pathogens. High-throughput sequencing (HTS) is a promising tool that can complement visual inspections, morphological identification and targeted molecular tests. HTS can be applied to a wide array of sample matrices, enabling the analysis of bulk samples while simultaneously targeting multiple taxa. The workflow includes multiple preparation steps and extensive post-sequencing bioinformatic analyses. It needs to be optimised and carefully documented to minimise and control the various biases introduced at each step. The results should be carefully interpreted and, if a species of concern is detected, it currently still needs to be confirmed by an independent method. In this article, we discuss the usefulness of HTS in the context of forest protection, considering different sample types, technical considerations and potential synergies with established methods.
Ključne besede:	orest health, metabarcoding, pests, fungal pathogens, high-throughput sequencing

Zbirka

To gradivo je del naslednjih zbirk del:

1. Acta Silvae et Ligni

Nazaj