Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije

Izpis gradiva
A+ | A- | Pomoč | SLO | ENG

Naslov:Transcriptome-informed identification and characterization of Planococcus citri cis- and trans-isoprenyl diphosphate synthase genes
Avtorji:ID Juteršek, Mojca (Avtor)
ID Gerasymenko, Iryna (Avtor)
ID Petek, Marko (Avtor)
ID Gruden, Kristina (Avtor)
ID Baebler, Špela (Avtor)
Datoteke:URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://doi.org/10.1016/j.isci.2024.109441
 
.pdf PDF - Izvorna datoteka, prenos (2,04 MB)
MD5: 271EE9E3D169614CAC6B53DD0C0515B2
 
Jezik:Angleški jezik
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:Logo NIB - Nacionalni inštitut za biologijo
Povzetek:Insect physiology and reproduction depend on several terpenoid compounds, whose biosynthesis is mainly unknown. One enigmatic group of insect monoterpenoids are mealybug sex pheromones, presumably resulting from the irregular coupling activity of unidentified isoprenyl diphosphate synthases (IDSs). Here, we performed a comprehensive search for IDS coding sequences of the pest mealybug Planococcus citri. We queried the available genomic and newly generated short- and long-read P. citri transcriptomic data and identified 18 putative IDS genes, whose phylogenetic analysis indicates several gene family expansion events. In vitro testing confirmed regular short-chain coupling activity with five gene products. With the candidate with highest IDS activity, we also detected low amounts of irregular coupling products, and determined amino acid residues important for chain-length preference and irregular coupling activity. This work therefore provides an important foundation for deciphering terpenoid biosynthesis in mealybugs, including the sex pheromone biosynthesis in P. citri.
Ključne besede:insect pheromones, isoprenyl diphosphate synthase, monoterpenes, phylogenetic analysis
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Datum objave:06.03.2024
Leto izida:2024
Št. strani:str. 1-18
Številčenje:iss. 4, [art. no.] ǂ109441
PID:20.500.12556/DiRROS-18584 Novo okno
UDK:577.2
ISSN pri članku:2589-0042
DOI:10.1016/j.isci.2024.109441 Novo okno
COBISS.SI-ID:189713411 Novo okno
Opomba:Soavtorji: Gerasymenko, M. Iryna; Petek, Marko; Haumman, Elisabeth; Vacas, Sandra; Kallam, Kalyani; Gianoglio, Silvia; Navarro-Llopis, Vicente; Heethoff, Michael; Navarro Fuertes, Ismael; Patron, Nicola; Orzáez, Diego; Gruden, Kristina; Warzecha, Heribert; Baebler, Špela; Nasl. z nasl. zaslona; Opis vira z dne 21. 3. 2024;
Datum objave v DiRROS:29.03.2024
Število ogledov:79
Število prenosov:33
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
  
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:iScience
Založnik:Cell Press, Elsevier
ISSN:2589-0042
COBISS.SI-ID:24098568 Novo okno

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:EC - European Commission
Program financ.:European Commission
Številka projekta:722361
Naslov:Cofund on Biotechnologies
Akronim:ERA CoBioTech

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0165-2022
Naslov:Biotehnologija in sistemska biologija rastlin

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:German Federal Ministry of Education and Research, program Forschung an Fachhochschulen
Številka projekta:031B060

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:UK Biotechnology and Biological Sciences Research Council
Številka projekta:BB/CSP1720/1
Naslov:Genomes to Food Security

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:Core Strategic Program Grant to the Earlham Institute
Številka projekta:BB/R021554/1

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:Spanish Ministry of Science and Innovation
Številka projekta:PLEC2021-008020
Naslov:PHEROPLUS

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:Generalitat Valenciana and the Fondo Social Europeo
Številka projekta:CIAPOS/2021/316
Naslov:postdoctoral grant

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.

Sekundarni jezik

Jezik:Latinski jezik
Ključne besede:žuželčji feromoni, izoprenil difosfat sintaze, monoterpeni, filogenetska analiza, Planococcus citri


Nazaj