Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije

Izpis gradiva
A+ | A- | Pomoč | SLO | ENG

Naslov:Increased diversity of citrus tristeza virus in Europe
Avtorji:ID Zindović, Jelena (Avtor)
ID Čizmović, Miroslav (Avtor)
ID Vučurović, Ana (Avtor)
ID Margaria, Paolo (Avtor)
ID Škorić, Dijana (Avtor)
Datoteke:URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://doi.org/10.1094/PDIS-09-23-1718-RE
 
.pdf PDF - Izvorna datoteka, prenos (1,18 MB)
MD5: A579E02147A5C4120382514AE8F861F1
 
Jezik:Angleški jezik
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:Logo NIB - Nacionalni inštitut za biologijo
Povzetek:This study investigated the genetic diversity of citrus tristeza virus (CTV) isolates from Montenegro and Croatia, European countries with the northernmost citrus growing regions situated on the Eastern Adriatic coast. Fifteen complete or nearly complete CTV genomes were reconstructed from high-throughput sequencing of samples collected in distinct municipalities in Montenegro and Opuzen municipality in Croatia. Phylogenetic analyses assigned some of the sequences to VT and T30 strains, previously recorded in Europe, while remarkably other isolates were placed in S1 and RB groups, which have not been reported in Europe so far. In addition, a new phylogenetic lineage including only isolates from Montenegro was delineated and tentatively proposed as the MNE cluster. Recombination analysis revealed evidence of 11 recombination events in the sequences obtained in this study, between isolates of related strains, within isolates of the same strain, and between distant strains. These findings show that CTV diversity in Europe is higher than reported before and calls for the re-evaluation of management strategies.
Ključne besede:complete genomes, genotyping, citrus tristeza virus, CTV, non-EU strain
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Datum objave:21.11.2023
Leto izida:2023
PID:20.500.12556/DiRROS-18580 Novo okno
UDK:632
ISSN pri članku:0191-2917
DOI:10.1094/PDIS-09-23-1718-RE Novo okno
COBISS.SI-ID:179551235 Novo okno
Opomba:Soavtorji: Miroslav Čizmović, Ana Vučurović, Paolo Margaria, and Dijana Škorić; Published online: 21 Nov 2023; Članek v PDF formatu obsega 34 str.;
Datum objave v DiRROS:29.03.2024
Število ogledov:84
Število prenosov:30
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
  
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Plant disease
Skrajšan naslov:Plant dis.
Založnik:American Phytopathological Society
ISSN:0191-2917
COBISS.SI-ID:5660935 Novo okno

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:EC - European Commission
Program financ.:European Commission
Številka projekta:871029
Naslov:European Virus Archive GLOBAL
Akronim:EVA-GLOBAL

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0165-2022
Naslov:Biotehnologija in sistemska biologija rastlin

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0407-2019
Naslov:Okoljska in aplikativna virologija: virusi, prijatelji in sovražniki

Financer:HRZZ - Croatian Science Foundation
Številka projekta:PS-2020-01-2960
Naslov:NanoPhyto

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:genomi, genotipizacija, HTS, virus tristeza citrusov, rastlinske bolezni


Nazaj