Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije

Izpis gradiva
A+ | A- | Pomoč | SLO | ENG

Naslov:GoMapMan : integration, consolidation and visualization of plant gene annotations within the MapMan ontology
Avtorji:ID Ramšak, Živa (Avtor)
ID Baebler, Špela (Avtor)
ID Rotter, Ana (Avtor)
ID Korbar, Matej (Avtor)
ID Mozetič, Igor (Avtor)
ID Usadel, Björn (Avtor)
ID Gruden, Kristina (Avtor)
Datoteke:URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite http://nar.oxfordjournals.org/content/42/D1/D1167.full.pdf+html
 
.pdf PDF - Predstavitvena datoteka, prenos (4,88 MB)
MD5: 4C72646A676D77C3CA5A728F476524A6
 
Jezik:Angleški jezik
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:Logo NIB - Nacionalni inštitut za biologijo
Povzetek:GoMapMan (http://www.gomapman.org) is an open web-accessible resource for gene functional annotations in the plant sciences. It was developed to facilitate improvement, consolidation and visualization of gene annotations across several plant species. GoMapMan is based on the MapMan ontology, organized in the form of a hierarchical tree of biological concepts, which describe gene functions. Currently, genes of the model species Arabidopsis and three crop species (potato, tomato and rice) are included. The main features of GoMapMan are (i) dynamic and interactive gene product annotation through various curation options; (ii) consolidation of gene annotations for different plant species through the integration of orthologue group information; (iii) traceability of gene ontology changes and annotations; (iv) integration of external knowledge about genes from different public resources; and (v) providing gathered information to high throughput analysis tools via dynamically generated export files. All of the GoMapMan functionalities are openly available, with the restriction on the curation functions, which require prior registration to ensure traceability of the implemented changes.
Ključne besede:genes, plants
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Datum objave:01.01.2014
Leto izida:2014
Št. strani:str. D1167-D1175
Številčenje:Vol. 42, iss. D1
PID:20.500.12556/DiRROS-20001 Novo okno
UDK:575.111
ISSN pri članku:0305-1048
DOI:10.1093/nar/gkt1056 Novo okno
COBISS.SI-ID:2966607 Novo okno
Datum objave v DiRROS:02.08.2024
Število ogledov:512
Število prenosov:262
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
RAMŠAK, Živa, BAEBLER, Špela, ROTTER, Ana, KORBAR, Matej, MOZETIČ, Igor, USADEL, Björn in GRUDEN, Kristina, 2014, GoMapMan : integration, consolidation and visualization of plant gene annotations within the MapMan ontology. Nucleic acids research [na spletu]. 2014. Vol. 42, no. D1, p. d1167–d1175. [Dostopano 29 marec 2025]. DOI 10.1093/nar/gkt1056. Pridobljeno s: https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&id=20001
Kopiraj citat
  
Objavi na:Bookmark and Share


Podobna dela iz repozitorija:
  1. Geni in rak
  2. Geni in nastanek melanoma
Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Nucleic acids research
Skrajšan naslov:Nucleic acids res.
Založnik:Oxford University Press
ISSN:0305-1048
COBISS.SI-ID:3269647 Novo okno

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J4-4165-2011
Naslov:Kompromisi obrambe in razvoja v večtrofični interakciji med krompirjem in dvema glavnima škodljivcema
Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J2-2353-2009
Naslov:Semantično odkrivanje zakonitosti v okolju spletnih servisov (SemantičniSoKD)
Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P2-0103-2009
Naslov:Tehnologije znanja
Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0165-2009
Naslov:Biotehnologija in sistemska biologija rastlin

Licence

Licenca:CC BY 3.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 3.0 Nedoločena
Povezava:https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/deed.sl
Opis:Dovoljuje kopiranje in razširjanje vsebin v kakršnemkoli mediju in obliki. Dovoljuje remixanje, urejanje, predelava in vključevanje vsebine v lastna dela v vse namene, tudi komercialne. Primerno morate navesti avtorja, povezavo do licence in označiti spremembe, če so kakšne nastale. To lahko storite na kakršenkoli razumen način, vendar ne na način, ki bi namigoval na to, da dajalec licence podpira vas ali vašo uporabo dela. Ne smete uporabiti pravnih določil ali tehničnih ukrepov, ki bi pravno omejili ali onemogočilo druge, da bi storili karkoli, kar licenca dovoli.

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:geni, rastline


Nazaj