Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije

Izpis gradiva
A+ | A- | Pomoč | SLO | ENG

Naslov:LAMP assay and rapid sample preparation method for on-site detection of flavescence dorée phytoplasma in grapevine
Avtorji:ID Kogovšek, Polona (Avtor)
ID Hodgetts, Jennifer (Avtor)
ID Hall, J. (Avtor)
ID Prezelj, Nina (Avtor)
ID Nikolić, Petra (Avtor)
ID Mehle, Nataša (Avtor)
ID Lenarčič, Rok (Avtor)
ID Rotter, Ana (Avtor)
ID Dickinson, M. (Avtor)
ID Boonham, Neil (Avtor)
ID Dermastia, Marina (Avtor)
ID Ravnikar, Maja (Avtor)
Datoteke:URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/ppa.12266/abstract;jsessionid=7850B082A5DCFD15057B22A9A431AFE1.f03t02
 
.pdf PDF - Predstavitvena datoteka, prenos (483,90 KB)
MD5: 658F0BDBF5F2A1BEA44A1431455F8AD8
 
URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://doi.org/10.1111/ppa.12266
 
Jezik:Angleški jezik
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:Logo NIB - Nacionalni inštitut za biologijo
Povzetek:In Europe the most devastating phytoplasma associated with grapevine yellows (GY) diseases is a quarantine pest, flavescence dorée (FDp), from the 16SrV taxonomic group. The on-site detection of FDp with an affordable device would contribute to faster and more efficient decisions on the control measures for FDp. Therefore, a real-time isothermal LAMP assay for detection of FDp was validated according to the EPPO standards and MIQE guidelines. The LAMP assay was shown to be specific and extremely sensitive, because it detected FDp in all leaf samples that were determined to be FDp infected using quantitative real-time PCR. The whole procedure of sample preparation and testing was designed and optimized for on-site detection and can be completed in one hour. The homogenization procedure of the grapevine samples (leaf vein, flower or berry) was optimized to allow direct testing of crude homogenates with the LAMP assay, without the need for DNA extraction, and was shown to be extremely sensitive.
Ključne besede:flavescence dorée, homogenization, loop-mediated isothermal amplification, on-site application, validation
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Datum objave:01.04.2015
Leto izida:2015
Št. strani:str. 286-296
Številčenje:Vol. 64, no. 2
PID:20.500.12556/DiRROS-19781 Novo okno
UDK:577.2
ISSN pri članku:0032-0862
DOI:10.1111/ppa.12266 Novo okno
COBISS.SI-ID:3175247 Novo okno
Datum objave v DiRROS:26.07.2024
Število ogledov:518
Število prenosov:363
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
KOGOVŠEK, Polona, HODGETTS, Jennifer, HALL, J., PREZELJ, Nina, NIKOLIĆ, Petra, MEHLE, Nataša, LENARČIČ, Rok, ROTTER, Ana, DICKINSON, M., BOONHAM, Neil, DERMASTIA, Marina in RAVNIKAR, Maja, 2015, LAMP assay and rapid sample preparation method for on-site detection of flavescence dorée phytoplasma in grapevine. Plant Pathology [na spletu]. 2015. Vol. 64, no. 2, p. 286–296. [Dostopano 28 marec 2025]. DOI 10.1111/ppa.12266. Pridobljeno s: https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&id=19781
Kopiraj citat
  
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Plant Pathology
Skrajšan naslov:Plant Pathol.
Založnik:Her Majesty's Stationery Office
ISSN:0032-0862
COBISS.SI-ID:5661191 Novo okno

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:EC - European Commission
Številka projekta:262032
Naslov:COST-EFFECTIVE HAND-HELD DEVICE FOR RAPID IN-FIELD DETECTION OF FLAVENSCENCE DOREE PHYTOPLASMA IN GRAPEVINES
Akronim:VITISENS
Financer:EC - European Commission
Program financ.:Erasmus Student mobility for Placements 2011/2012
Naslov:scholarship

Licence

Licenca:CC BY-NC-ND 3.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 3.0 Nedoločena
Povezava:https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/deed.sl
Opis:Dovoljuje kopiranje in razširjanje vsebin v kakršnemkoli mediju in obliki. Primerno morate navesti avtorja, povezavo do licence in označiti spremembe, če so kakšne nastale. To lahko storite na kakršenkoli razumen način, vendar ne na način, ki bi namigoval na to, da dajalec licence podpira vas ali vašo uporabo dela. Te vsebine ne smete uporabiti v komercialne namene. Če vsebino predelate (remixate), uredite ali na njej gradite, spremenjene vsebine ne smete razširjati. Ne smete uporabiti pravnih določil ali tehničnih ukrepov, ki bi pravno omejili ali onemogočilo druge, da bi storili karkoli, kar licenca dovoli.

Nazaj