Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije

Izpis gradiva
A+ | A- | SLO | ENG

Naslov:Subspecies-specific sequence detection for differentiation of Mycobacterium abscessus complex
Avtorji:Minias, Alina (Avtor)
Żukowska, Lidia (Avtor)
Lach, Jakub (Avtor)
Jagielski, Tomasz (Avtor)
Strapagiel, Dominik (Avtor)
Kim, Su-Young (Avtor)
Koh, Won-Jung (Avtor)
Adam, Heather (Avtor)
Bittner, Ruth (Avtor)
Truden, Sara (Avtor)
Žolnir-Dovč, Marija (Avtor)
Dziadek, Jarosław (Avtor)
Jezik:Angleški jezik
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:Logo UKPBAG - Univerzitetna klinika za pljučne bolezni in alergijo Golnik
Povzetek:Mycobacterium abscessus complex (MABC) is a taxonomic group of rapidly growing, nontuberculous mycobacteria that are found as etiologic agents of various types of infections. They are considered as emerging human pathogens. MABC consists of 3 subspecies - M. abscessus subsp. bolletti, M. abscessus subsp. massiliense and M. abscessus subsp. abscessus. Here we present a novel method for subspecies differentiation of M. abscessus named Subspecies-Specific Sequence Detection (SSSD). This method is based on the presence of signature sequences present within the genomes of each subspecies of MABC. We tested this method against a virtual database of 1505 genome sequences of MABC. Further, we detected signature sequences of MABC in 45 microbiological samples through DNA hybridization. SSSD showed high levels of sensitivity and specificity for differentiation of subspecies of MABC, comparable to those obtained by rpoB sequence typing.
Ključne besede:Mycobacterium abscessus complex, nontuberculous mycobacteria, diagnosis
Leto izida:2020
Založnik:Springer Nature
Izvor:Velika Britanija
UDK:579
ISSN pri članku:2045-2322
OceCobissID:18727432 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS_ID:38347779 Povezava se odpre v novem oknu
DOI:10.1038/s41598-020-73607-x Povezava se odpre v novem oknu
Opombe:Nasl. z nasl. zaslona; Soavtorici iz Slovenije: Sara Truden, Manca Žolnir-Dovč; Opis vira z dne 19. 11. 2020; Article no. 16415;
Število ogledov:11128
Število prenosov:322
Datoteke:.pdf PDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,23 MB)
.zip ZIP - Priloga, prenos (4,12 MB)
URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://www.nature.com/articles/s41598-020-73607-x.pdf
 
Nadgradivo:Sci. rep.
Nature Publishing Group
 
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
Avtorske pravice:© The Author(s) 2020
:
  
Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.


Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Začetek licenciranja:02.10.2020

Nazaj