251. Gene expression levels of the prolyl hydroxylase domain proteins PHD1 and PHD2 but not PHD3 are decreased in primary tumours and correlate with poor prognosis of patients with surgically resected non-small-cell lung cancerAna Koren, Matija Rijavec, Tomaž Krumpestar, Izidor Kern, Aleksander Sadikov, Tanja Čufer, Peter Korošec, 2021, izvirni znanstveni članek Povzetek: Background: Hypoxia correlates with poor prognosis in several cancer types, including lung cancer. Prolyl hydroxylase domain proteins (PHDs) play a role in cell oxygen sensing, negatively regulating the hypoxia-inducible factor (HIF) pathway. Our study aim was to evaluate PHD1, PHD2 and PHD3 mRNA expression levels in primary tumours and normal lungs of non-small-cell lung cancer (NSCLC) patients and to correlate it with selected regulators of HIF signalling, with clinicopathological characteristics and overall survival (OS). Methods: Tumour tissue samples were obtained from 60 patients with surgically resected NSCLC who were treated with radical surgery. In 22 out of 60 cases, matching morphologically normal lung tissue was obtained. PHD1, PHD2 and PHD3 mRNA expressions were measured using RT-qPCR. Results: The PHD1 and PHD2 mRNA levels in primary tumours were significantly decreased compared to those in normal lungs (both p < 0.0001). PHD1 and PHD2 expression in tumours was positively correlated (rs = 0.82; p < 0.0001) and correlated well with HIF pathway downstream genes HIF1A, PKM2 and PDK1. Decreased PHD1 and PHD2 were associated with larger tumour size, higher tumour stage (PHD1 only) and squamous cell carcinoma. Patients with low PHD1 and patients with low PHD2 expression had shorter OS than patients with high PHD1 (p = 0.02) and PHD2 expression (p = 0.01). PHD1 showed borderline independent prognostic values in multivariate analysis (p = 0.06). In contrast, we found no associations between PHD3 expression and any of the observed parameters. Conclusions: Our results show that reduced expression of PHD1 and PHD2 is associated with the development and progression of NSCLC. PHD1 could be further assessed as a prognostic marker in NSCLC.
Ključne besede: non-small-cell lung carcinoma, prognosis, non-small cell lung cancer, mRNA expression, prolyl hydroxylase domain proteins
Objavljeno v DiRROS: 21.05.2021; Ogledov: 1242; Prenosov: 882
 Celotno besedilo (820,49 KB)
Gradivo ima več datotek! Več... |
252. |
253. Ocena stanja ohranjenosti habitatnega tipa 91E0* Obrečna vrbovja, jelševja in jesenovja v območju Natura 2000 Ličenca pri PoljčanahAjša Alagić, Lado Kutnar, Erika Kozamernik, Valerija Babij, Aleksander Marinšek, Janez Kermavnar, Anica Simčič, Ruben Šprah, 2021, izvirni znanstveni članek Povzetek: Stanje ohranjenosti sestojev habitatnega tipa 91E0* Obrečna vrbovja, jelševja in jesenovja (Alno-Padion, Alnion incanae, Salicion albae) je v Sloveniji precej zaskrbljujoče. V Sloveniji je bilo njegovo stanje ocenjeno kot slabo, trend pa negativen, kar pomeni dodatno možnost poslabšanja. Omenjeni gozdni habitatni tip sodi med prioritetne ali prednostne habitatne tipe, za katere je predvidena posebna skrb Evropske skupnosti. Zaradi njegove majhnosti in fragmentiranosti je pogosto spregledan in tudi neustrezno obravnavan. Z namenom, da bi izboljšali njegovo prepoznavnost in spoznali njegove značilnosti na terenu, smo mu v okviru LIFE integriranega projekta za okrepljeno upravljanje Nature 2000 v Sloveniji namenili posebno pozornost. V raziskavi smo z uporabo metode terenskega kartiranja podrobneje proučili stanje sestojev habitatnega tipa 91E0* v območju Natura 2000 Ličenca pri Poljčanah. Na tak način smo ugotovili, kakšna je površina sestojev tega habitatnega tipa in jo primerjali z obstoječimi conami habitatnega tipa 91E0*. Ugotavljali smo pojavljanje ključnih drevesnih vrst oz. drevesno sestavo sestojev, njihovo pomlajevanje ter vrste pritiskov in groženj za habitatni tip 91E0* na tem območju. Izmed različnih znanih podtipov habitatnega tipa 91E0* smo na tem območju našli predvsem podtip nižinsko črnojelševje, pa tudi fragmente podtipa vrbovja s topolom. Ponekod so se tudi v gozdu pojavljali manjši sestoji vrb in ozkolistnega jesena. Ugotovili smo, da površine sestojev habitatnega tipa 91E0* na območju Natura 2000 Ličenca pri Poljčanah dejansko zavzemajo le približno četrtino površine obstoječih con habitatnega tipa. Analiza drevesne sestave sestojev je pokazala predvsem vraščanje smreke v sestojih črnojelševja, le-ta naravno ni prisotna v tem habitatnem tipu. Ugotovili smo, da je na proučevanem območju pomlajevanje črne jelše zelo okrnjeno. Na slabšanje stanja sestojev črnojelševja še dodatno vplivajo različni pritiski in grožnje, kot so bližina kmetijskih površin, odpadki, fragmentacija sestojev črnojelševja, širjenje invazivnih tujerodnih rastlin, vodne regulacije, bližina prometnic, izsuševanje rastišč idr. Stanje ohranjenosti sestojev tega habitatnega tipa je bilo posledično v večini primerov ocenjeno kot neugodno do slabo. Z namenom, da bi se stanje obrečnih gozdov na območju Ličence pri Poljčanah izboljšalo, smo v prispevku predlagali nekaj konkretnih ohranitvenih ukrepov
Ključne besede: habitatni tip, črnojelševje, obrečni gozdovi, terensko kartiranje, stanje ohranjenosti, Alnus glutinosa, Natura 2000
Objavljeno v DiRROS: 14.04.2021; Ogledov: 1634; Prenosov: 560
Celotno besedilo (1,25 MB) |
254. Radiološka slikovna diagnostika gliomov pri odraslihAna Leben, Katarina Šurlan Popović, 2019, ni določena Povzetek: Gliomi so najpogostejši primarni možganski tumorji. Po novih smernicah jih razlikujemo na podlagi molekularnih označevalnikov, kar daje pomembno podlago za razvoj zdravljenja po meri bolnika. Tipizacija tumorjev je lahko invazivna s pomočjo biopsije in neinvazivna. Zadnja v zadnjem času pridobiva veliko vlogo zaradi razvoja radiogenomike, ki preučuje povezavo med slikovnimi fenotipi tumorjev in genomiko. Magnetnoresonančna ocena tumorjev, pri kateri uporabljamo številne standardne in funkcionalne sekvence, omogoča neinvazivno tipizacijo tumorjev glede na specifične morfološke značilnosti posameznih vrst tumorjev s posameznimi molekularnimi označevalci. Po pregledu obstoječe literature so avtorji v članku opisali slikovne značilnosti treh tumorskih genotipov, in sicer mutacije izocitratne dehidrogenaze, kodelecije 1p19q in metilacije promotorja metilgvanin metiltansferaze. Kljub hitremu razvoju radiogenomike primanjkuje obširnih študij z dovolj velikimi in standardiziranimi vzorci bolnikov, ki bi podale zanesljivejše rezultate.
Ključne besede: rak (medicina), gliomi, molekularni markerji, magnetna resonanca, slikovna diagnostika, radiološka diagnostika
Objavljeno v DiRROS: 08.04.2021; Ogledov: 1186; Prenosov: 404
Celotno besedilo (1,03 MB) |
255. |
256. Vpliv epidemije covid-19 na diagnostiko in zdravljenje rakaVesna Zadnik, Ana Mihor, Sonja Tomšič, Tina Žagar, Nika Bric, Katarina Lokar, 2020, objavljeni strokovni prispevek na konferenci Ključne besede: obvladovanje raka, covid-19, javno zdravje
Objavljeno v DiRROS: 07.04.2021; Ogledov: 1383; Prenosov: 360
Celotno besedilo (148,08 KB) |
257. CRP projekt : vpliv epidemije covid-19 na obvladovanje raka v SlovenijiTina Žagar, Sonja Tomšič, Mario Fafangel, Mateja Krajc, Ana Mihor, Vesna Zadnik, 2020, objavljeni strokovni prispevek na konferenci Ključne besede: obvladovanje raka, covid-19, javno zdravje
Objavljeno v DiRROS: 07.04.2021; Ogledov: 1100; Prenosov: 316
Celotno besedilo (99,24 KB) |
258. |
259. Navodila za izvajanje programa Zora : državni program Zgodnjega Odkrivanja predRAkavih sprememb materničnega vratu (Zora)Marjetka Uršič-Vrščaj, Maja Primic-Žakelj, Irena Kirar-Fazarinc, Ana Pogačnik, Dunja Obersnel Kveder, 2003, slovar, enciklopedija, leksikon, priročnik, atlas, zemljevid Objavljeno v DiRROS: 24.03.2021; Ogledov: 1040; Prenosov: 378
Celotno besedilo (1,84 MB) |
260. Drought stress can induce the pathogenicity of Cryptostroma corticale, the causal agent of sooty bark disease of sycamore mapleNikica Ogris, Ana Brglez, Barbara Piškur, 2021, izvirni znanstveni članek Povzetek: Reports of sooty bark disease of maples caused by the fungus Cryptostroma corticale have recently been emerging from across Europe. The aims of our study were to describe the first report of sooty bark disease in Slovenia, to determine the pathogenicity of C. corticale, to confirm the optimum temperature for the growth of the fungus, and to determine the mass loss of Acer pseudoplatanus wood inoculated by C. corticale. We confirmed the presence of C. corticale on A. pseudoplatanus via morphological and molecular analysis. The optimal growth of C. corticale was measured in vitro on potato dextrose agar and was determined to occur at 25 °C. Pathogenicity tests were performed on 30 saplings of A. pseudoplatanus under two treatments, humid and drought stress, and the fungus was pathogenic in both treatments. The mean length of bark lesions and wood discoloration of the drought-stressed saplings was significantly greater than that in the humid treatment. Re-isolations of C. corticale were successful from all inoculated saplings, and thus Koch%s postulates were confirmed. The mass loss of A. pseudoplatanus wood was determined by mini-block test in a period of 10 weeks and was observed as minimal. Based on the results, we conclude that C. corticale is a weak and opportunistic pathogen that most likely expresses itself intensively under hot and dry conditions.
Ključne besede: pathogenicity, drought stress, optimal growth, climate change, mass loss, mini-block test, wood rot, opportunistic pathogen, saprophyte, endophyte
Objavljeno v DiRROS: 23.03.2021; Ogledov: 1169; Prenosov: 879
Celotno besedilo (3,21 MB)
Gradivo ima več datotek! Več... |
