1. Meloidogyne luci: an emerging threat to agriculture and challenges in diagnostics and sustainable managementJasmina Bačić, Ivana Lalićević, Nik Susič, Saša Širca, Barbara Gerič Stare, Maria Lurdes Inácio, Carla Maleita, 2026, pregledni znanstveni članek Ključne besede: integrated pest management, molecular identification, plant resistance, quarantine nematodes, nematodes Objavljeno v DiRROS: 22.07.2026; Ogledov: 171; Prenosov: 108
Celotno besedilo (11,46 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
2. First integrative characterisation of the root-knot nematode, Meloidogyne luci infecting chickpea (Cicer arietinum) in EthiopiaHabtamu Kefelegn, Marjolein Couvreur, Wim M.L. Wesemael, Beira H. Meressa, André Machado Bertran, Jop Wilten, Barbara Gerič Stare, Nik Susič, Nicole Viaene, Misghina G. Teklu, Wim Bert, 2026, izvirni znanstveni članek Ključne besede: DNA barcoding, genomics, host status, mitogenome, molecular, morphology, phylogeny, root-knot nematodes, SEM, taxonomy Objavljeno v DiRROS: 31.03.2026; Ogledov: 369; Prenosov: 250
Celotno besedilo (4,26 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
3. Detecting nematodes in potato plants : An explainable machine learning approach for detection of potato cyst nematode infections using hyperspectral imagingJanez Lapajne, Nik Susič, Andrej Vončina, Barbara Gerič Stare, Nicole Viaene, Jonathan Van Beek, David Nuyttens, Saša Širca, Uroš Žibrat, 2025, izvirni znanstveni članek Ključne besede: hyperspectral imaging, machine learning, potato plant, potato, potato cyst nematodes Objavljeno v DiRROS: 26.03.2026; Ogledov: 415; Prenosov: 319
Celotno besedilo (3,52 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
4. Monitoring of root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) in Croatia (2022–2024) : occurrence, distribution and species identificationTamara Rehak Biondić, Jasna Milanović, Ivan Poje, Luka Popović, Mirjana Brmež, Barbara Gerič Stare, 2025, izvirni znanstveni članek Ključne besede: morphological identification, root-knot nematodes, nematodes, survey, molecular identification, Croatia Objavljeno v DiRROS: 28.10.2025; Ogledov: 848; Prenosov: 346
Povezava na datoteko |
5. Occurrence and distribution of root-knot nematodes Meloidogyne spp. in SerbiaJasmina Bačić, Ivana Lalićević, Saša Širca, Melita Theuerschuh, Nik Susič, Barbara Gerič Stare, 2025, izvirni znanstveni članek Povzetek: This study examines the occurrence and distribution of root-knot nematodes (RKN), Meloidogyne spp., in Serbia through an official survey conducted from 2021 to 2023. A total of 241 plant and soil samples were collected from 25 districts across two regions: Northern Serbia (Vojvodina Province) and Central Serbia. RKN infestations were detected in 23.7% of the samples. Among the 57 identified populations, 5 Meloidogyne species were recorded: M. incognita, M. hapla, M. luci, M. arenaria and M. javanica. Meloidogyne luci was reported in Serbia for the first time, marking a significant finding for nematology in the region. This study highlights the importance of implementing effective pest management strategies to mitigate the agricultural impact of RKN in Serbia. Ključne besede: molecular identification, root-knot nematodes, nematodes, morphological identification, distribution, Serbia Objavljeno v DiRROS: 05.02.2025; Ogledov: 1355; Prenosov: 734
Celotno besedilo (831,59 KB) Gradivo ima več datotek! Več... |
6. Potato (Solanum tuberosum) - a new host for the root-knot nematode Meloidogyne inornataBarbara Gerič Stare, Nik Susič, Maja Starovič, Saša Širca, 2022, drugi znanstveni članki Ključne besede: pathogenicity, plant-parasitic nematodes, nematodes, root-knot nematodes, potato Objavljeno v DiRROS: 27.07.2023; Ogledov: 10855; Prenosov: 915
Celotno besedilo (615,48 KB) Gradivo ima več datotek! Več... |
7. Analysis of putative apoplastic effectors from the nematode, Globodera rostochiensis, and identification of an expansin-like protein that can induce and suppress host defensesBarbara Gerič Stare, Shawkat Ali, Maxime Magne, Shiyan Chen, Olivier Côte, Natasa Obradovic, Lubna Jamshaid, Xiaohong Wang, Guy Bélair, Peter Moffett, 2015, izvirni znanstveni članek Ključne besede: nematode, expansin-like protein, expansin, potato cyst nematode, potato pest, parasitic nematodes, plant celular function Objavljeno v DiRROS: 06.09.2022; Ogledov: 2023; Prenosov: 904
Povezava na celotno besedilo |
8. Uporaba naprednih tehnologij za celostno obvladovanje ogorčic koreninskih šišk (Meloidogyne spp., Nematoda: Meloidogynidae)Nik Susič, 2020, doktorska disertacija Povzetek: Tropske vrste ogorčic koreninskih šišk (RKN) so izredno polifagni škodljivci v kmetijstvu, kjer povzročajo velike izgube pridelka. Nekatere vrste, kot so Meloidogyne ethiopica, M. inornata in M. luci (MEG), je zaradi visoke sorodnosti težavno razlikovati. Sekvencirali smo 7 izolatov ogorčic iz skupine MEG ter po zlaganju zaporedij genomov določili filogenetsko umestitev v rod. Zloženi genom ogorčice M. luci SI-Smartno V13 je s 327 kontigi, N50 dolžini kontigov 1,7 Mb in končni dolžini zloženega zaporedja 209,2 Mb, trenutno najpopolnejši javno dostopen genom RKN. Filogenetska analiza je pokazala na umestitev vseh izolatov iz skupine MEG v enoten monofiletski klad, vrsta M. luci se je bistveno razlikovala od vrst M. ethiopica in M. inornata. Preizkušali smo uporabnost hiperspektralnega slikanja za zgodnje razločevanje biotskega stresa (napad RKN) od abiotskega stresa (suša) pri rastlinah paradižnika. Z analizo hiperspektralnih posnetkov v območju spektra 400-2500 nm je bilo mogoče razlikovati med dobro zalitimi ter sušnimi rastlinami s 100 % natančnostjo, z 90-100 % natančnostjo pa je bilo mogoče razlikovati med zdravimi in napadenimi rastlinami. Ovrednotili smo nematicidno aktivnost in analizirali genoma bakterij Bacillus firmus I-1582 in Bacillus sp. ZZV12-4809, v katerih smo našli številne potencialne dejavnike virulence. V lončnih poskusih in na mikroparcelah je sev I-1582 zmanjšal število ogorčic M. luci za 51-53 % v primerjavi s kontrolo. Bakterije I-1582 so delovale nematicidno ter spodbudile rast rastlin, kar smo pokazali z meritvami morfologije rastlin, relativne vsebnosti klorofila, vsebnostjo elementov in analizo hiperspektralnih posnetkov. Z analizo hiperspektralnih posnetkov z nadzorovano klasifikacijo smo uspešno razlikovali med rastlinami tretiranimi z B. firmus in rastlinami brez bakterij – v lončnem poskusu smo dosegli 97,4 % uspešnost, na mikroparcelah pa 96,3 %. Ključne besede: ogorčice koreninskih šišk, filogenomika, hiperspektralno slikanje, biotično varstvo rastlin, Meloidogyne spp., Bacillus firmus, doktorske disertacije Objavljeno v DiRROS: 06.09.2022; Ogledov: 3883; Prenosov: 743
Povezava na celotno besedilo |
9. Microarray-based uncovering of reference genes for quantitative real-time PCR in potato tuber infected with PVYBarbara Gerič Stare, Aleš Sedlar, Vladimir Meglič, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: potato, potato tuber, tuber infection, potato virus Y, real-time PCR, PCR, polymerase chain reaction, reference genes, stored ppotato tubers, pathogens Objavljeno v DiRROS: 31.05.2021; Ogledov: 3883; Prenosov: 937
Celotno besedilo (488,30 KB) |
10. |