Digital repository of Slovenian research organisations

Search the repository
A+ | A- | Help | SLO | ENG

Query: search in
search in
search in
search in

Options:
  Reset


Query: "keywords" (DNA) .

11 - 15 / 15
First pagePrevious page12Next pageLast page
11.
Genska terapija v onkologiji, prvi razvojni koraki v Sloveniji
Maja Čemažar, Tanja Jesenko, Maša Omerzel, Boštjan Markelc, Urška Kamenšek, Simona Kranjc Brezar, Špela Kos, Urša Lampreht Tratar, Katarina Žnidar, Andrej Renčelj, Urška Matkovič, Teja Valant, Kristina Levpušček, Živa Modic, Tilen Komel, Tim Božič, Urša Kešar, Barbara Starešinič, Katja Uršič Valentinuzzi, Monika Savarin, Primož Strojan, Gorana Gašljević, Maja Ota, Aleš Grošelj, Črt Jamšek, Rosana Hudej, Matjaž Peterka, Franc Smrekar, Barbara Hubad, Marjan Hosta, Jaka Kužnik, Alojz Hosta, Damijan Miklavčič, Matej Reberšek, Aleksandra Cvetkoska, Anja Zajc, Janja Dermol-Černe, Nataša Tozon, Nina Milevoj, Alenka Nemec Svete, Gregor Serša, 2022, professional article

Abstract: Genska terapija postaja čedalje bolj zanimiva tudi v onkologiji. Med aplikacijami je morda najzanimivejša imunostimulacija. Pripravimo lahko plazmidno DNA, ki nosi zapis za različne imunostimulatorne molekule, ki jih vnesemo v celice tumorjev ali normalnih tkiv. Ta tkiva postanejo proizvajalci teh molekul, ki lahko delujejo lokalno ali pa se izločajo tudi sistemsko v krvni obtok. Ker plazmidna DNA ne prehaja celične membrane, so potrebni dostavni sistemi, virusni ali nevirusni. V naših študijah uporabljamo predvsem nevirusni dostavni sistem – elektroporacijo. Interlevkin 12 (IL-12) je eden od zanimivih citokinov, za katerega je znano protitumorsko delovanje s spodbujanjem imunskega odziva in antiangiogenim delovanjem. Namen projekta SmartGene.si je bil pripraviti plazmid z zapisom za interlevkin 12 (plazmid phIL12) in pripraviti vse potrebno za njegovo klinično testiranje za zdravljenje kožnih tumorjev. V konzorciju smo združili moči s partnerji z akademskega in industrijskega področja. Treba je bilo pripraviti plazmid za uporabo v humani onkologiji po zahtevah Evropske agencije za zdravila (EMA). Za prijavo klinične študije na Javno agencijo za zdravila in medicinske pripomočke (JAZMP) smo morali izvesti tudi vse neklinične raziskave o varnosti in učinkovitosti zdravila. Nato je bilo treba razviti postopek priprave zdravila, zagotoviti primerne prostore za pripravo in izvedbo postopka priprave zdravila. V treh letih smo dosegli vse te zastavljene cilje in dobili dovoljenje za izvajanje klinične študije na kožnih tumorjih, ki ga je izdala JAZMP na osnovi pozitivnega mnenja Komisije Republike Slovenije za medicinsko etiko. Zdaj poteka klinična študija faze I preizkušanja plazmida phIL12 na kožnih tumorjih glave in vratu z namenom preveriti varnost in sprejemljivost genskega elektroprenosa plazmida v tumorje. Cilj študije je prav tako določiti primeren odmerek zdravila, ki bi ga v nadaljnji klinični študiji uporabili kot adjuvantno zdravljenje k ablativnim terapijam, kot sta radioterapija ali elektrokemoterapija.
Keywords: genska terapija, interlevkin-12, plazmidna DNA, elektroprenos genov, rak kože
Published in DiRROS: 01.07.2022; Views: 1191; Downloads: 241
.pdf Full text (420,40 KB)

12.
13.
Pan-European phylogeography of the European roe deer (Capreolus capreolus)
Kamila Plis, Magdalena Niedziałkowska, Tomasz Borowik, Johannes Lang, Mike Heddergott, Juha Tiainen, Aleksey Bunevich, Nikica Šprem, Ladislav Paule, Aleksey A. Danilkin, Marina Kholodova, Elena Zvychaynaya, Nadezhda Kashinina, Boštjan Pokorny, Katarina Flajšman, 2022, original scientific article

Abstract: To provide the most comprehensive picture of species phylogeny and phylogeography of European roe deer (Capreolus capreolus), we analyzed mtDNA control region (610 bp) of 1469 samples of roe deer from Central and Eastern Europe and included into the analyses additional 1541 mtDNA sequences from GenBank from other regions of the continent. We detected two mtDNA lineages of the species: European and Siberian (an introgression of C. pygargus mtDNA into C. capreolus). The Siberian lineage was most frequent in the eastern part of the continent and declined toward Central Europe. The European lineage contained three clades (Central, Eastern, and Western) composed of several haplogroups, many of which were separated in space. The Western clade appeared to have a discontinuous range from Portugal to Russia. Most of the haplogroups in the Central and the Eastern clades were under expansion during the Weichselian glacial period before the Last Glacial Maximum (LGM), while the expansion time of the Western clade overlapped with the Eemian interglacial. The high genetic diversity of extant roe deer is the result of their survival during the LGM probably in a large, contiguous range spanning from the Iberian Peninsula to the Caucasus Mts and in two northern refugia.
Keywords: Capreolus capreolus, expansion, mitochondrial DNA, the Last Glacial Maximum refugia, the Quaternary history, Phylogenetics
Published in DiRROS: 26.05.2022; Views: 609; Downloads: 421
.pdf Full text (3,91 MB)
This document has many files! More...

14.
Phylogenetic relations and range history of jerboas of the Allactaginae subfamily (Dipodidae, Rodentia)
Vladimir S. Lebedev, Georgy I. Shenbrot, Boris Kryštufek, Ahmad Mahmoudi, Marina N. Melnikova, Evgeniya N. Solovyeva, Alexandra A. Lisenkova, Enkhbat Undrakhbayar, Konstantin A. Rogovin, Alexey V. Surov, Ana A. Bannikova, 2022, original scientific article

Abstract: Five-toed jerboas of the subfamily Allactaginae comprise several complex taxa occurring over a wide distribution range covering a large part of the Eurasian arid belt. In this study, we employed current methods of molecular phylogenetics based on 15 nuclear genes and the mitochondrial gene cytb to revise relations and systematics within Allactaginae. We also applied species distribution modelling projected on paleo-environmental data to reconstruct the geographic patterns of speciation in Allactaginae. We elucidated the intergeneric relationships within this subfamily and clarifed interspecies relations within the genus Scarturus. Moreover, our results demonstrate the species status of S. caprimulga; outline the currently understudied diversity within Orientallactaga, Allactaga, and Pygeretmus; and improve the divergence estimates of these taxa. Based on our results from modelling of geographic range fragmentation in allactagines, we suggest the dating and location of speciation events and present hypotheses regarding general habitat niche conservatism in small mammals.
Keywords: molecular phylogeny, mitochondrial DNA, nuclear DNA, habitat modelling, phylogenetic history
Published in DiRROS: 28.01.2022; Views: 729; Downloads: 605
.pdf Full text (11,47 MB)
This document has many files! More...

15.
Vpliv glivnih in rastlinskih sekundarnih metabolitov na verižno reakcijo s polimerazo (PCR)
Nejc Thaler, Marko Bajc, 2013, review article

Abstract: Sekundarni metaboliti so organske spojine, ki jih najdemo pri glivah in rastlinah, kjer imajo vlogo obrambnih in signalnih molekul ali zagotavljajo druge selekcijske prednosti, niso pa neposredno vpleteni v rast, razvoj in razmnoževanje organizma. Pri delu s tehnikami DNA so pogosto ravno sekundarni metaboliti tisti, ki posredno ali neposredno vplivajo na uspešnost verižne reakcije s polimerazo (PCR) ali reverezno transkriptazo, in sicer tako, da otežujejo celično lizo, povzročajo razpad nukleinskih kislin ali neposredno ovirajo delovanje encima polimeraze pri pomnoževanju tarčne DNK. Glavna ovira pri aplikaciji tehnike PCR v rutinski diagnostiki je priprava visoko kvalitetne DNA brez inhibitorjev. Še posebej to velja pri izolaciji DNA iz lesnatih rastlin (Minafra in sod., 1992) in vzorcev tal (Tsai in Olson, 1991). Večina standardnih postopkov izolacije nukleinskih kislin ne odstrani rastlinskih polisaharidov in polifenolnih komponent, ki imajo lahko neposreden vpliv na pomnoževanje s PCR (Demeke in Adams, 1992). Poskusi za premostitev tovrstnih ovir vključujejo bolj dovršene metode za izolacijo nukleinskih kislin in PCR, ki vključujejo uporabo pospeševalcev PCR za odstranitev ali zmanjšanje vpliva inhibitorjev PCR. Ta pregled je osredotočen na pristope za odstranitev ali zmanjšanje vplivov rastlinskih in glivnih sekundarnih metabolitov iz vzorcev tal, različnih rastlinskih tkiv in razkrojenega lesa zaradi pomena tovrstnih raziskav za gozdarstvo in lesarstvo.
Keywords: sekundarni metaboliti, izolacija DNA, pomnoževanje DNA, verižna reakcija, polimeraza, PCR
Published in DiRROS: 12.07.2017; Views: 4967; Downloads: 2281
.pdf Full text (685,41 KB)

Search done in 0.19 sec.
Back to top