1. Vzorčenje bentoških nevretenčarjev v rekah brez vpliva kraškega izvira Evdinarske subhidroekoregije za pripravo metodologije vrednotenja ekološkega stanja : končno poročiloMojca Hrovat, Gorazd Urbanič, Maja Sever, Špela Ambrožič Ergaver, Barbara Debeljak, Mihael Jožef Toman, 2012, final research report Abstract: Direktiva 2000/60/ES določa okvir za delovanje Skupnosti na področju vodne politike in upravljanja z vodami. Namen Vodne direktive je preprečevanje nadaljnjega slabšanja stanja vodnih ekosistemov ter varstvo in izboljšanje vodnega okolja. Dobro ekološko stanje površinskih vodnih teles naj bi članice dosegle do konca leta 2015. Bentoški nevretenčarji so eden izmed bioloških elementov, ki so vključeni v sistem razvrščanja vodnih teles rek in jezer po ekološkem stanju. Kot podpora biološkim elementom so v sistem razvrščanja vključeni še podporni hidromorfološki elementi ter kemijski in fizikalno-kemijski elementi. Pridobitev ustreznih podatkov o bioloških in podpornih elementih je prvi korak za pripravo ustrezne metodologije vrednotenja ekološkega stanja voda v skladu z Vodno direktivo (Direktiva 2000/60/ES).
V poročilu “Vzorčenje bentoških nevretenčarjev v rekah brez vpliva kraškega izvira Evdinarske subhidroekoregije za pripravo metodologije vrednotenja ekološkega stanja” so predstavljeni rezultati v skladu s pogodbo št. 38-864/12. Terenske, laboratorijske in kabinetne obdelave ter meritve so bile opravljene v skladu z Uredbo o stanju površinskih voda (Uradni list št. 14, 2009) in Pravilniku o monitoringu stanja površinskih voda (Uradni list št. 10, 2009). V poročilu so zbrani vsi izpolnjeni delovni protokoli za opis mest vzorčenja za vse vzorčene reke. Prav tako so zbrani podatki o merjenih fizikalno-kemijskih parametrih in številčnosti najdenih taksonov. Slike vzorčnih mest so le na priloženem CD-ju.
Keywords: vzorčenje bentoških nevretenčarjev, vrednotenje ekološkega stanja
Published in DiRROS: 16.09.2024; Views: 650; Downloads: 41
 Full text (1,19 MB)
This document has many files! More... |
2. Preiskave kakovosti vode ribnika Tivoli in Koseškega bajerja : končno poročiloMateja Germ, Urška Kuhar, Alenka Gaberščik, Tina Eleršek, Gorazd Urbanič, Gorazd Kosi, Majda Ivanušič, Dušan Fortuna, Mojca Hrovat, Maja Pavlin Urbanič, Barbara Debeljak, final research report Abstract: Vodna telesa, kot sta Tivolski ribnik in Koseški bajer, so pomembni elementi mest. Kot antropogeni tvorbi sta pomembna tako z vidika naravne kot tudi kulturne dediščine. Raziskave so pokazale, da predstavljajo ribniki v spremenjeni krajini, kjer so vodotoki večinoma regulirani in naravni obrežni pasovi okrnjeni ali celo odstranjeni, habitate in zatočišča za različne ptice in žuželke. To je posebej pomembno v mestih, kjer je biotska pestrost zaradi človekovih posegov močno zmanjšana. Z vidika ekosistemskih storitev imajo ribniki pomembno socialno vlogo, saj njihova okolica predstavlja mesto za sprostitev, sama vodna telesa pa lahko služijo tudi v izobraževalne namene. Njihova vloga je tudi podporna, saj uravnavajo okoljske razmere (blažijo temperaturna nihanja in povečujejo vlažnost zraka) na območju. Zaradi intezivnih bioloških procesov se različne snovi, ki prihajajo v ribnike s spiranjem in pritoki, tam razgradijo ali spremenijo. Vse vloge pa so povezane z celovitostjo življenjske združbe in uravnoteženostjo procesov v ribnikih, saj je znano, da je lahko ekološki potencial siromašnih evtrofnih sistemov močno zmanjšan.
Za oceno učinkov v letu 2011 izvedene sanacije ribnika Tivoli ter ovrednotenje stanja Koseškega bajerja smo v letih 2012 in 2013 v skladu s projektno nalogo Preiskave kakovosti vode ribnika Tivoli in Koseškega bajerja opravili preiskave obeh ribnikov. Izvedli smo vzorčenje fitoplanktona, bentoških nevretenčarjev, fitobentosa in makrofitov ter opravili meritve in vzorčenje vode za fizikalno-kemijske analize. V končnem poročilu so zbrani rezultati analiz, ocenjeno je stanje obeh vodnih teles ter predlagani ukrepi za izboljšanje stanja. Ker metodologija za izdelavo ocene ekološkega potenciala še ni pripravljena, smo vodni telesi uvrstili v trofične kategorije. Izjema je le vrednotenje na osnovi bentoških nevretenčarjev.
Keywords: ekologija sladkih voda
Published in DiRROS: 16.09.2024; Views: 47; Downloads: 931
Full text (3,18 MB)
This document has many files! More... |
3. Zero-shot evaluation of ChatGPT for food named-entity recognition and linkingMatevž Ogrinc, Barbara Koroušić-Seljak, Tome Eftimov, 2024, original scientific article Abstract: Introduction: Recognizing and extracting key information from textual data plays an important role in intelligent systems by maintaining up-to-date knowledge, reinforcing informed decision-making, question-answering, and more. It is especially apparent in the food domain, where critical information guides the decisions of nutritionists and clinicians. The information extraction process involves two natural language processing tasks named entity recognition—NER and named entity linking—NEL. With the emergence of large language models (LLMs), especially ChatGPT, many areas began incorporating its knowledge to reduce workloads or simplify tasks. In the field of food, however, we noticed an opportunity to involve ChatGPT in NER and NEL.
Methods: To assess ChatGPT's capabilities, we have evaluated its two versions, ChatGPT-3.5 and ChatGPT-4, focusing on their performance across both NER and NEL tasks, emphasizing food-related data. To benchmark our results in the food domain, we also investigated its capabilities in a more broadly investigated biomedical domain. By evaluating its zero-shot capabilities, we were able to ascertain the strengths and weaknesses of the two versions of ChatGPT.
Results: Despite being able to show promising results in NER compared to other models. When tasked with linking entities to their identifiers from semantic models ChatGPT's effectiveness falls drastically.
Discussion: While the integration of ChatGPT holds potential across various fields, it is crucial to approach its use with caution, particularly in relying on its responses for critical decisions in food and bio-medicine.
Keywords: ChatGPT, food data, named-entity recognition, named-entity linking
Published in DiRROS: 16.09.2024; Views: 49; Downloads: 23
Full text (1,08 MB)
This document has many files! More... |
4. Poročilo o preskusu št.: LVG 2024-120 : vzorec št. 2024/00622Nikica Ogris, Špela Hočevar, Barbara Piškur, 2024, expertise, arbitration decision Keywords: varstvo gozdov, morfološke analize, bor, borov smolasti rak, karantenski škodljiv organizem, Diplodia pinea, sušica najmlajših borovih poganjkov
Published in DiRROS: 12.09.2024; Views: 128; Downloads: 0
This document has many files! More... |
5. Patient-derived tumor organoids mimic treatment-induced DNA damage response in glioblastomaBernarda Majc, Anamarija Habič, Marta Malavolta, Miloš Vittori, Andrej Porčnik, Roman Bošnjak, Jernej Mlakar, Alenka Matjašič, Andrej Zupan, Marija Skoblar Vidmar, Tamara Lah Turnšek, Aleksander Sadikov, Barbara Breznik, Metka Novak, 2024, original scientific article Abstract: Glioblastoma (GB) is the most common primary malignant brain tumor, characterized by resistance to therapy. Despite aggressive treatment options, GB remains an incurable disease. Invasiveness and heterogeneity are key GB features that cannot be studied in preclinical in vitro models. In this study, we investigated the effects of standard therapy using patient-derived GB organoids (GBOs). GBOs reflect the complexity and heterogeneity of the original tumor tissue. No significant effect on GBO viability or invasion was observed after irradiation and temozolomide treatment. E3 ubiquitin-protein ligase (MDM2), cyclin-dependent kinase inhibitor 1A (CDKN1A), and the serine/threonine kinases ATM and ATR were upregulated at the gene and protein levels after treatment. Our results show that the p53 pathway and DNA-damage response mechanisms were triggered, suggesting that GBOs recapitulate GB therapy resistance. GBOs thus provide a highly efficient platform to assess the specific responses of GB patients to therapy and to further explore therapy resistance.
Keywords: cellular physiology, cellular toxicology, in vitro toxicology including 3D culture, technical aspects of cell biology, cancer
Published in DiRROS: 09.09.2024; Views: 148; Downloads: 83
Full text (9,14 MB)
This document has many files! More... |
6. |
7. |
8. |
9. |
10. Poročilo o preskusu št.: LVG 2024-108 : vzorec št. 2024/00625Barbara Piškur, Patricija Podkrajšek, Špela Hočevar, 2024, expertise, arbitration decision Keywords: varstvo gozdov, morfološke analize, program preiskav, Fusarium circinatum, borov smolasti rak, PCR v realnem času
Published in DiRROS: 05.09.2024; Views: 100; Downloads: 0
This document has many files! More... |
