Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije

Izpis gradiva
A+ | A- | Pomoč | SLO | ENG

Naslov:Functional genomics screening in Chlamydomonas reinhardtii maps the genetic landscape of tolerance to paraquat and diuron
Avtorji:ID Godec, Tim (Avtor)
ID Bleker, Carissa (Avtor)
ID Stare, Katja (Avtor)
ID Lukan, Tjaša (Avtor)
ID Levak, Valentina (Avtor)
ID Tušek-Žnidarič, Magda (Avtor)
ID Kosjek, Tina, Institut "Jožef Stefan" (Avtor)
ID Van Midden, Katarina Petra (Avtor)
ID Klemenčič, Marina (Avtor)
ID Sepčić, Kristina (Avtor)
ID Kerenčič, Maruša (Avtor)
ID Eleršek, Tina (Avtor)
ID Bren, Urban (Avtor)
ID Jukič, Marko (Avtor)
ID Lešnik, Samo (Avtor)
ID Županič, Anže (Avtor)
Datoteke:URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.est.5c17308
 
.pdf PDF - Predstavitvena datoteka, prenos (7,27 MB)
MD5: 9DBFAE0ACBF4D7BF363E2E0E43548B84
 
Jezik:Angleški jezik
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:Logo IJS - Institut Jožef Stefan
Povzetek:Functional genomics offers a powerful, unbiased approach to elucidating the molecular mechanisms underlying the toxicity of environmental pollutants. In this study, we applied genome-wide screening in Chlamydomonas reinhardtii to investigate two classical herbicides: paraquat and diuron. Our screen successfully uncovered critical nuclear-encoded pathways that govern susceptibility. For both herbicides, we identified genes regulating the assembly and maintenance of the photosynthetic machinery, highlighting the central role of nuclear control over these chloroplast-localized targets. Beyond these target-related factors, we discovered novel nontarget-site resistance mechanisms. For paraquat, we identified intracellular trafficking as the central determinant of toxicity, experimentally characterizing a P5B ATPase transporter and a fatty acid elongation pathway whose disruption, we propose, converges on the same endomembrane delivery route through sphingolipid depletion. In contrast, our screening data suggest that diuron tolerance may be associated with a metabolic strategy focused on energy conservation, where the inactivation of specific NADPH-consuming enzymes could preserve reducing power for essential antioxidant defense. Collectively, these findings demonstrate that functional genomics can reveal novel, complex modes of action even for well-characterized chemicals, providing the mechanistic resolution required to advance modern ecotoxicological risk assessments.
Ključne besede:paraquat, diuron
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Poslano v recenzijo:01.12.2025
Datum sprejetja članka:14.05.2026
Datum objave:27.05.2026
Založnik:American Chemical Society
Leto izida:2026
Št. strani:str. A-P
Številčenje:Vol. 60, iss.
Izvor:ZDA
PID:20.500.12556/DiRROS-29923 Novo okno
UDK:575.111
ISSN pri članku:1520-5851
DOI:10.1021/acs.est.5c17308 Novo okno
COBISS.SI-ID:280635139 Novo okno
Avtorske pravice:© 2026 The Authors.
Opomba:Nasl. z nasl. zaslona; Soavtorji iz Slovenije: Carissa Bleker, Katja Stare, Tjaša Lukan, Valentina Levak, Magda Tušek Žnidarič, Tina Kosjek, Katarina P van Midden, Marina Klemenčič, Kristina Sepčić, Maruša Kerenčič, Tina Eleršek, Urban Bren, Marko Jukić, Samo Lešnik, Anže Županič; Opis vira z dne 5. 6. 2026;
Datum objave v DiRROS:09.06.2026
Število ogledov:65
Število prenosov:47
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
  
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Environmental science & technology
Skrajšan naslov:Environ. sci. technol.
Založnik:American Chemical Society
ISSN:1520-5851
COBISS.SI-ID:18984231 Novo okno

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:SNSF - Swiss National Science Foundation
Številka projekta:159966
Naslov:Genome-scale metabolic modeling to predict mechanisms of toxicity and adverse outcomes after exposure of Chlamydomonas reinhardtii to single chemicals and chemical mixtures - GEMTOX

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J4-2550-2020
Naslov:Identifikacija genskih determinant kemične toksičnosti zelene algeChlamydomonas reinhardtii

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0165-2022
Naslov:Biotehnologija in sistemska biologija rastlin

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0143-2020
Naslov:Kroženje snovi v okolju, snovna bilanca in modeliranje okoljskih procesov ter ocena tveganja

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0463-2026
Naslov:Biotehnologija in sistemska biologija rastlin

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0207-2020
Naslov:Toksini in biomembrane

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-60001-2025
Naslov:Raziskovanje analgetičnega potenciala herkinorina: celostni pristop k varnejšim opioidom

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:L7-60161-2025
Naslov:Razvoj elektrokemijskega biosenzorja za detekcijo metil živega srebra

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-50034-2023
Naslov:Knjižnica korelacij med vezavnimi vzorci opioidov in njihovimi neželenimi stranskimi učinki

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J7-50043-2023
Naslov:Mutacijska platforma koronavirusnih terapevtskih tarč za študij vpliva mutacij na učinkovitost in izbiro zdravil ter načrtovanje novih pan-koronavirusnih zaviralcev

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P2-0438-2022
Naslov:Optični kemijski/bio senzorski sistemi (OPTISENS)

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:I0-E015-2026
Naslov:BBMRI

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0403-2019
Naslov:Računsko intenzivni kompleksni sistemi

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:I0-0004-2022
Naslov:Infrastrukturni program NIB

Financer:NSF - National Science Foundation
Program financ.:Directorate for Biological Sciences
Številka projekta:1914989
Naslov:Collaborative Research: A community resource for genome-scale identification of genotype-phenotype relationships in a model photosynthetic eukaryote

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Začetek licenciranja:27.05.2026
Vezano na:VoR

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:parakvat, diuron, Chlamydomonas reinhardtii


Nazaj