Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije

Izpis gradiva
A+ | A- | Pomoč | SLO | ENG

Naslov:Subspecies-specific sequence detection for differentiation of Mycobacterium abscessus complex
Avtorji:ID Minias, Alina (Avtor)
ID Żukowska, Lidia (Avtor)
ID Lach, Jakub (Avtor)
ID Jagielski, Tomasz (Avtor)
ID Strapagiel, Dominik (Avtor)
ID Kim, Su-Young (Avtor)
ID Koh, Won-Jung (Avtor)
ID Adam, Heather (Avtor)
ID Bittner, Ruth (Avtor)
ID Truden, Sara, Klinika Golnik (Avtor)
ID Žolnir-Dovč, Marija, Klinika Golnik (Avtor)
ID Dziadek, Jarosław (Avtor)
Datoteke:.pdf PDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,23 MB)
MD5: A46DF102BA18581FE05EFC69C4D9A26E
 
.zip ZIP - Priloga, prenos (4,12 MB)
MD5: 19FA2F9CEA4C9546680DD62253778CEB
 
URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://www.nature.com/articles/s41598-020-73607-x.pdf
 
Jezik:Angleški jezik
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:Logo UKPBAG - Univerzitetna klinika za pljučne bolezni in alergijo Golnik
Povzetek:Mycobacterium abscessus complex (MABC) is a taxonomic group of rapidly growing, nontuberculous mycobacteria that are found as etiologic agents of various types of infections. They are considered as emerging human pathogens. MABC consists of 3 subspecies - M. abscessus subsp. bolletti, M. abscessus subsp. massiliense and M. abscessus subsp. abscessus. Here we present a novel method for subspecies differentiation of M. abscessus named Subspecies-Specific Sequence Detection (SSSD). This method is based on the presence of signature sequences present within the genomes of each subspecies of MABC. We tested this method against a virtual database of 1505 genome sequences of MABC. Further, we detected signature sequences of MABC in 45 microbiological samples through DNA hybridization. SSSD showed high levels of sensitivity and specificity for differentiation of subspecies of MABC, comparable to those obtained by rpoB sequence typing.
Ključne besede:Mycobacterium abscessus complex, nontuberculous mycobacteria, diagnosis
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Kraj izida:Velika Britanija
Založnik:Springer Nature
Leto izida:2020
Št. strani:str. 1-9
Številčenje:Vol. 10
PID:20.500.12556/DiRROS-12693 Novo okno
UDK:579
ISSN pri članku:2045-2322
DOI:10.1038/s41598-020-73607-x Novo okno
COBISS.SI-ID:38347779 Novo okno
Avtorske pravice:© The Author(s) 2020
Opomba:Nasl. z nasl. zaslona; Soavtorici iz Slovenije: Sara Truden, Manca Žolnir-Dovč; Opis vira z dne 19. 11. 2020; Article no. 16415;
Datum objave v DiRROS:23.11.2020
Število ogledov:12684
Število prenosov:1420
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
MINIAS, Alina, ŻUKOWSKA, Lidia, LACH, Jakub, JAGIELSKI, Tomasz, STRAPAGIEL, Dominik, KIM, Su-Young, KOH, Won-Jung, ADAM, Heather, BITTNER, Ruth, TRUDEN, Sara, ŽOLNIR-DOVČ, Marija in DZIADEK, Jarosław, 2020, Subspecies-specific sequence detection for differentiation of Mycobacterium abscessus complex. Scientific reports [na spletu]. 2020. Vol. 10, p. 1–9. [Dostopano 26 marec 2025]. DOI 10.1038/s41598-020-73607-x. Pridobljeno s: https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&id=12693
Kopiraj citat
  
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Scientific reports
Skrajšan naslov:Sci. rep.
Založnik:Nature Publishing Group
ISSN:2045-2322
COBISS.SI-ID:18727432 Novo okno

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Začetek licenciranja:02.10.2020

Sekundarni jezik

Jezik:Ni določen
Ključne besede:kompleks Mycobacterium abscessus, netuberkulozne mikobakterije, diagnostika


Nazaj