Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije

Izpis gradiva
A+ | A- | Pomoč | SLO | ENG

Naslov:Network modelling unravels mechanisms of crosstalk between ethylene and salicylate signalling in potato
Avtorji:ID Ramšak, Živa (Avtor)
ID Coll Rius, Anna (Avtor)
ID Stare, Tjaša (Avtor)
ID Tzfadia, Oren (Avtor)
ID Baebler, Špela (Avtor)
ID Van de Peer, Yves (Avtor)
ID Gruden, Kristina (Avtor)
Datoteke:URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite http://dx.doi.org/10.1104/pp.18.00450
 
.pdf PDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,77 MB)
MD5: FDB9519CC225B5FEEFF37359AA65C00D
 
Jezik:Angleški jezik
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:Logo NIB - Nacionalni inštitut za biologijo
Povzetek:To develop novel crop breeding strategies, it is crucial to understand the mechanisms underlying the interaction between plants and their pathogens. Network modeling represents a powerful tool that can unravel properties of complex biological systems. In this study, we aimed to use network modeling to better understand immune signaling in potato (Solanum tuberosum). For this, we first built on a reliable Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) immune signaling model, extending it with the information from diverse publicly available resources. Next, we translated the resulting prior knowledge network (20,012 nodes and 70,091 connections) to potato and superimposed it with an ensemble network inferred from time-resolved transcriptomics data for potato. We used different network modeling approaches to generate specific hypotheses of potato immune signaling mechanisms. An interesting finding was the identification of a string of molecular events illuminating the ethylene pathway modulation of the salicylic acid pathway through Nonexpressor of PR Genes1 gene expression. Functional validations confirmed this modulation, thus supporting the potential of our integrative network modeling approach for unraveling molecular mechanisms in complex systems. In addition, this approach can ultimately result in improved breeding strategies for potato and other sensitive crops.
Ključne besede:network modelling, potato, molecular biology
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Datum objave:01.09.2018
Leto izida:2018
Št. strani:str. 488-499
Številčenje:Vol. 178
PID:20.500.12556/DiRROS-19986 Novo okno
UDK:577
ISSN pri članku:0032-0889
DOI:10.1104/pp.18.00450 Novo okno
COBISS.SI-ID:4778575 Novo okno
Datum objave v DiRROS:01.08.2024
Število ogledov:485
Število prenosov:357
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
RAMŠAK, Živa, COLL RIUS, Anna, STARE, Tjaša, TZFADIA, Oren, BAEBLER, Špela, VAN DE PEER, Yves in GRUDEN, Kristina, 2018, Network modelling unravels mechanisms of crosstalk between ethylene and salicylate signalling in potato. Plant physiology [na spletu]. 2018. Vol. 178, p. 488–499. [Dostopano 15 april 2025]. DOI 10.1104/pp.18.00450. Pridobljeno s: https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&id=19986
Kopiraj citat
  
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Plant physiology
Skrajšan naslov:Plant physiol.
Založnik:American Society of Plant Physiologists
ISSN:0032-0889
COBISS.SI-ID:5661703 Novo okno

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0165-2015
Naslov:Biotehnologija in sistemska biologija rastlin
Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J4-7636-2016
Naslov:Prostorsko časovna analiza hipersenzitivnega odziva krompirja na krompirjev virus Y
Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J7-7303-2016
Naslov:Analiza heterogenih informacijskih omrežij za odkrivanje zakonitosti v znanostih o življenju
Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:N4-0026-2014
Naslov:Priprava molekularnih postopkov za sistemsko analizo imunskega odgovora krompirja

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.

Nazaj