Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije

Izpis gradiva
A+ | A- | Pomoč | SLO | ENG

Naslov:Fifty Aureobasidium pullulans genomes reveal a recombining polyextremotolerant generalist
Avtorji:ID Gostinčar, Cene (Avtor)
ID Turk, Martina (Avtor)
ID Zajc, Janja (Avtor)
ID Gunde-Cimerman, Nina (Avtor)
Datoteke:URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://doi.org/10.1111/1462-2920.14693
 
.pdf PDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,09 MB)
MD5: C95B2FF28E62084A44D22064A2D84360
 
Jezik:Angleški jezik
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:Logo NIB - Nacionalni inštitut za biologijo
Povzetek:The black yeast Aureobasidium pullulans is a textbook example of a generalistic and ubiquitous fungus thriving in a wide variety of environments. To investigate whether A. pullulans is a true generalist, or alternatively, whether part of its versatility can be attributed to intraspecific specialization masked by cryptic diversification undetectable by traditional phylogenetic analyses, we sequenced and analysed the genomes of 50 strains of A. pullulans from different habitats and geographic locations. No population structure was observed in the sequenced strains. Decay of linkage disequilibrium over shorter physical distances (<100 bp) than in many sexually reproducing fungi indicates a high level of recombination in the species. A homothallic mating locus was found in all of the sequenced genomes. Aureobasidium pullulans appears to have a homogeneous population genetics structure, which is best explained by good dispersal and high levels of recombination. This means that A. pullulans is a true generalist that can inhabit different habitats without substantial specialization to any of these habitats at the genomic level. Furthermore, in the future, the high level of A. pullulans recombination can be exploited for the identification of genomic loci that are involved in the many biotechnologically useful traits of this black yeast.
Ključne besede:black yeast, genome
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Datum objave:01.10.2019
Leto izida:2019
Št. strani:str. 3638-3652
Številčenje:Vol. 21, iss. 10
PID:20.500.12556/DiRROS-19587 Novo okno
UDK:577.21
ISSN pri članku:1462-2912
DOI:10.1111/1462-2920.14693 Novo okno
COBISS.SI-ID:5158991 Novo okno
Datum objave v DiRROS:24.07.2024
Število ogledov:195
Število prenosov:139
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
  
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Environmental microbiology
Skrajšan naslov:Environ. microbiol.
Založnik:Blackwell Science
ISSN:1462-2912
COBISS.SI-ID:626197 Novo okno

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0170-2018
Naslov:Molekulski mehanizmi uravnavanja celičnih procesov v povezavi z nekaterimi boleznimi pri človeku

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0207-2015
Naslov:Toksini in biomembrane

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:Z7-7436-2016
Naslov:Na stres tolerantne kvasovke iz rodu Aureobasidium: uporaba v biološki kontroli nekaterih rastlinskih bolezni

Licence

Licenca:CC BY-NC-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl
Opis:Najbolj omejujoča licenca Creative Commons. Uporabniki lahko prenesejo in delijo delo v nekomercialne namene in ga ne smejo uporabiti za nobene druge namene.

Nazaj