Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije

Izpis gradiva
A+ | A- | Pomoč | SLO | ENG

Naslov:A mini-TGA protein modulates gene expression through heterogeneous association with transcription factors
Avtorji:ID Tomaž, Špela (Avtor)
ID Petek, Marko (Avtor)
ID Lukan, Tjaša (Avtor)
ID Pogačar, Karmen (Avtor)
ID Stare, Katja (Avtor)
ID Teixeira Prates, Erica (Avtor)
ID Jacobson, Daniel A. (Avtor)
ID Zrimec, Jan (Avtor)
ID Bajc, Gregor (Avtor)
ID Butala, Matej (Avtor)
ID Pompe Novak, Maruša (Avtor)
ID Taler-Verčič, Ajda (Avtor)
ID Usenik, Aleksandra (Avtor)
ID Turk, Dušan (Avtor)
ID Coll Rius, Anna (Avtor)
ID Gruden, Kristina (Avtor)
Datoteke:URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://doi.org/10.1093/plphys/kiac579
 
.pdf PDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,37 MB)
MD5: 7E5CE539ECE1AFFC607A26125B8999D4
 
Jezik:Angleški jezik
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:Logo NIB - Nacionalni inštitut za biologijo
Povzetek:TGA (TGACG-binding) transcription factors, which bind their target DNA through a conserved basic region leucine zipper (bZIP) domain, are vital regulators of gene expression in salicylic acid (SA)-mediated plant immunity. Here, we investigated the role of StTGA2.1, a potato (Solanum tuberosum) TGA lacking the full bZIP, which we named a mini-TGA. Such truncated proteins have been widely assigned as loss-of-function mutants. We, however, confirmed that StTGA2.1 overexpression compensates for SA-deficiency, indicating a distinct mechanism of action compared with model plant species. To understand the underlying mechanisms, we showed that StTGA2.1 can physically interact with StTGA2.2 and StTGA2.3, while its interaction with DNA was not detected. We investigated the changes in transcriptional regulation due to StTGA2.1 overexpression, identifying direct and indirect target genes. Using in planta transactivation assays, we confirmed that StTGA2.1 interacts with StTGA2.3 to activate StPRX07, a member of class III peroxidases (StPRX), which are known to play role in immune response. Finally, via structural modeling and molecular dynamics simulations, we hypothesized that the compact molecular architecture of StTGA2.1 distorts DNA conformation upon heterodimer binding to enable transcriptional activation. This study demonstrates how protein truncation can lead to distinct functions and that such events should be studied carefully in other protein families.
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Datum objave:01.03.2023
Leto izida:2022
Št. strani:str. 1934–1952
Številčenje:Vol. 191, iss. 3
PID:20.500.12556/DiRROS-19501 Novo okno
UDK:578
ISSN pri članku:0032-0889
DOI:10.1093/plphys/kiac579 Novo okno
COBISS.SI-ID:135092739 Novo okno
Opomba:Ostali avtorji: Marko Petek, Tjaša Lukan, Karmen Pogačar, Katja Stare, Erica Teixeira Prates, Daniel A Jacobson, Jan Zrimec, Gregor Bajc, Matej Butala, Maruša Pompe Novak, Quentin Dudley, Nicola Patron, Ajda Taler-Verčič, Aleksandra Usenik, Dušan Turk, Salomé Prat, Anna Coll, Kristina Gruden;
Datum objave v DiRROS:18.07.2024
Število ogledov:10
Število prenosov:4
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
  
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Plant physiology
Skrajšan naslov:Plant physiol.
Založnik:American Society of Plant Physiologists
ISSN:0032-0889
COBISS.SI-ID:5661703 Novo okno

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0165
Naslov:Biotehnologija in sistemska biologija rastlin

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J4-1777
Naslov:Odkrivanje mehanizmov učinkovitosti in specifičnosti imunske signalizacije v krompirju z inovativnim pridobivanjem podatkov in modeliranjem

Financer:ARIS - Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-2467
Naslov:Odkrivanje dinamike omrežja v interakciji krompirjev virus Y-rastlinska celica

Financer:EC - European Commission
Program financ.:H2020
Številka projekta:862858
Naslov:Accelerated Development of multiple-stress tolerAnt PoTato
Akronim:ADAPT

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:Plant-Microbe Interfaces (PMI) Scientific Focus Area in the Genomic Sciences Program

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:US Department of Energy
Številka projekta:DE-AC05-00OR22725

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:proteini mini-TGA, rastlinski imunski odziv, transkripcijski faktorji TGA, virus krompirja Y


Nazaj