1. PS-AAS : portfolio selection for automated algorithm selection in black-box optimizationAna Kostovska, Gjorgjina Cenikj, Diederick Vermetten, Anja Janković, Ana Nikolikj, Urban Škvorc, Peter Korošec, Carola Doerr, Tome Eftimov, 2023, objavljeni znanstveni prispevek na konferenci Ključne besede: automated algorithm selection, portfolio selection, black box optimization Objavljeno v DiRROS: 11.12.2023; Ogledov: 249; Prenosov: 94 Celotno besedilo (1,90 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
2. Sensitivity analysis of RF+clust for leave-one-problem-out performance predictionAna Nikolikj, Michal Pluhacek, Carola Doerr, Peter Korošec, Tome Eftimov, 2023, objavljeni znanstveni prispevek na konferenci Ključne besede: automated performance prediction, autoML, single-objective black-box optimization, zero-shot learning Objavljeno v DiRROS: 13.11.2023; Ogledov: 315; Prenosov: 187 Celotno besedilo (4,94 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
3. Algorithm instance footprint : separating easily solvable and challenging problem instancesAna Nikolikj, Sašo Džeroski, Mario Andrés Muñoz, Carola Doerr, Peter Korošec, Tome Eftimov, 2023, objavljeni znanstveni prispevek na konferenci Ključne besede: black-box optimization, algorithms, problem instances, machine learning Objavljeno v DiRROS: 15.09.2023; Ogledov: 278; Prenosov: 183 Celotno besedilo (2,03 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
4. Assessing the generalizability of a performance predictive modelAna Nikolikj, Gjorgjina Cenikj, Gordana Ispirova, Diederick Vermetten, Ryan Dieter Lang, Andries Petrus Engelbrecht, Carola Doerr, Peter Korošec, Tome Eftimov, 2023, objavljeni znanstveni prispevek na konferenci Ključne besede: algorithms, predictive models, machine learning Objavljeno v DiRROS: 15.09.2023; Ogledov: 295; Prenosov: 193 Celotno besedilo (935,67 KB) Gradivo ima več datotek! Več... |
5. DynamoRep : trajectory-based population dynamics for classification of black-box optimization problemsGjorgjina Cenikj, Gašper Petelin, Carola Doerr, Peter Korošec, Tome Eftimov, 2023, objavljeni znanstveni prispevek na konferenci Ključne besede: black-box single-objective optimization, optimization problem classification, problem representation, meta-learning Objavljeno v DiRROS: 30.08.2023; Ogledov: 324; Prenosov: 220 Celotno besedilo (650,13 KB) Gradivo ima več datotek! Več... |
6. Vloga radioterapije pri oligometastatskih gastrointestinalnih rakihPeter Korošec, 2022, objavljeni znanstveni prispevek na konferenci Povzetek: Zdravljenje s stereotaktično radioterapijo (SBRT) se je v zadnjih letih tudi pri oligometastatskem gastrointestinalnem raku izkazalo za eno izmed pomembnejših možnosti lokalnega ablativnega zdravljenja, ki izboljšuje tako lokalno kontrolo, preživetje brez bolezni, kot tudi celokupno preživetje. Ob tem pa se je stereotaktično obsevanje izkazalo za varno metodo. Glede na lokacijo zasevkov so najpogosteje obsevani zasevki v jetrih in pljučih. Zaradi višje radiorezistentence zasevkov je potrebna večja izsevana doza (BED ≥ 100 Gy). Za čim manj stranskih učinkov pa je potrebna uporaba sistemov, ki zmanjšujejo gibanje tarče in povečujejo natančnost obsevanja. Večina dokazov do sedaj sicer temelji na retrospektivnih analizah in manjših prospektivnih študijah faze I in II. Rezultati prospektivnih študij faze III pa nam bodo v prihodnosti potrdili kdaj in kateri pacienti bodo imeli od zdravljenja z obsevanjem največjo korist. Ključne besede: gastrointestinalni rak, radioterapija, rak prebavil Objavljeno v DiRROS: 13.01.2023; Ogledov: 438; Prenosov: 114 Celotno besedilo (84,10 KB) |
7. |
8. Oligometastatski rakIvica Ratoša, Karmen Stanič, Tanja Ovčariček, Ajra Šečerov Ermenc, Janka Čarman, Blaž Grošelj, Staša Jelerčič, Peter Korošec, Manja Šešek, Marko Kokalj, Gaber Plavc, Miha Oražem, Helena Barbara Zobec Logar, 2022, pregledni znanstveni članek Povzetek: Oligometastatska bolezen (OMB) predstavlja vmesno stanje med lokalno napredovalo boleznijo in obsežnejšo metastatsko boleznijo. Zaenkrat ne poznamo specifičnih biomarkerjev, ki bi nam pomagali opredeliti bolnike z majhnim bremenom bolezni, zato diagnoza OMB temelji na slikovni diagnostiki. V zadnjih letih narašča zanimanje za optimizacijo zdravljenja OMB predvsem zaradi obetavnih rezultatov dodatka lokalnega k obstoječemu sistemskemu zdravljenju. S takšnim načinom zdravljenja se je prvič pokazala možnost doseganja dolgotrajnih zazdravitev ali redko celo ozdravitev teh bolnikov. Razlikovanje posameznih vrst OMB in njihovo enotno poimenovanje je pomembno zlasti v kliničnih raziskavah, saj nam omogoča medsebojno primerjavo rezultatov različnih raziskav. Ključne besede: klasifikacija, oligometastatska bolezen, sistemsko zdravljenje, onkologija Objavljeno v DiRROS: 06.12.2022; Ogledov: 504; Prenosov: 134 Celotno besedilo (246,61 KB) |
9. Smernice za zdravljenje bolnikov z rakom požiralnika in ezofagogastričnega stika (EGS)Franc Anderluh, Marko Boc, Goran Gačevski, Gorana Gašljević, Samo Horvat, Nežka Hribernik, Marija Ignjatović, Ana Jeromen, Jera Jeruc, Peter Korošec, Tanja Mesti, Srdjan Novaković, Irena Oblak, Janja Ocvirk, Martina Reberšek, Nada Rotovnik-Kozjek, Matevž Srpčič, Ajra Šečerov Ermenc, Borut Štabuc, Vaneja Velenik, Neva Volk, Vesna Zadnik, 2022, slovar, enciklopedija, leksikon, priročnik, atlas, zemljevid Ključne besede: rak požiralnika, rak ezofagogastritičnega stika, smernice, zdravljenje Objavljeno v DiRROS: 07.09.2022; Ogledov: 686; Prenosov: 264 Celotno besedilo (3,50 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
10. Art v 1 IgE epitopes of patients and humanized mice are conformationalMaja Zabel, Milena Weber, Bernhard Kratzer, Cordula Köhler, Beatrice Jahn-Schmid, Gabriele Gadermaier, Pia Gattinger, Urška Bidovec, Peter Korošec, Ursula Smole, Rudolf Valenta, Winfried F. Pickl, 2022, izvirni znanstveni članek Povzetek: Background: Worldwide, pollen of the weed mugwort (Artemisia vulgaris) is a major cause of severe respiratory allergy, with its major allergen, Art v 1, being the key pathogenic molecule for millions of patients. Humanized mice transgenic for a human T-cell receptor specific for the major Art v 1 T-cell epitope and the corresponding HLA have been made. Objective: We sought to characterize IgE epitopes of Art v 1–sensitized patients and humanized mice for molecular immunotherapy of mugwort allergy. Methods: Four overlapping peptides incorporating surface-exposed amino acids representing the full-length Art v 1 sequence were synthesized and used to search for IgE reactivity to sequential epitopes. For indirect mapping, peptide-specific rabbit antibodies were raised to block IgE against surface-exposed epitopes on folded Art v 1. IgE reactivity and basophil activation studies were performed in clinically defined mugwort-allergic patients. Secondary structure of recombinant (r) Art v 1 and peptides was determined by circular dichroism spectroscopy. Results: Mugwort-allergic patients and humanized mice sensitized by allergen inhalation showed IgE reactivity and/or basophil activation mainly to folded, complete Art v 1 but not to unfolded, sequential peptide epitopes. Blocking of allergic patients’ IgE with peptide-specific rabbit antisera identified a hitherto unknown major conformational IgE binding site in the C-terminal Art v 1 domain. Conclusions: Identification of the new major conformational IgE binding site on Art v 1, which can be blocked with IgG raised against non-IgE reactive Art v 1 peptides, is an important basis for the development of a hypoallergenic peptide vaccine for mugwort allergy. Ključne besede: mugwort pollen allergy, IgE epitope, allergen-specific immunotherapy Objavljeno v DiRROS: 31.08.2022; Ogledov: 530; Prenosov: 211 Povezava na datoteko |