<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="30932" NadgradivoID="143" NRID="28881042" OceID="0" DomainUrl="https://dirros.openscience.si/" IzpisPolniUrl="https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=30932" StOgledov="27" StPrenosov="13" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-07-09 20:21:03" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/DiRROS-30932">20.500.12556/DiRROS-30932</PID>
  <Naslov>How to build Dynamic Energy Budget models</Naslov>
  <Podnaslov>practical guidelines for model development</Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>Dynamic Energy Budget (DEB) theory provides a coherent framework to describe how organisms acquire and use energy and matter throughout the life cycle in response to environmental conditions. The wide applicability suggests the generality of DEB theory and is one of its main strengths. However, this same generality introduces a substantial degree of abstraction, which can make model development challenging, particularly for newcomers. This paper aims to support more transparent, biologically grounded, and reproducible DEB modeling by proposing guidelines to make the development process more explicit and accessible. We identify three main challenges: (1) how to link biological processes to their mathematical representation, (2) which observations are needed to inform key physiological processes, and (3) how to carry out parameter estimation and model validation in a transparent and reproducible way. To help overcome these issues, we briefly introduce core concepts and discuss the six main steps in the DEB modeling workflow: model design, data collection and assessment, implementation, calibration, validation, and publication. These steps are illustrated with a case study on zebrafish (Danio rerio) that demonstrates how data availability influences model development and the range of predictions that can be supported. By proposing a structured workflow, we hope to encourage researchers to explore the full potential of DEB theory.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>modeling development workflow</Beseda>
    <Beseda>bioenergetics</Beseda>
    <Beseda>good modeling practices</Beseda>
    <Beseda>estimation in-context</Beseda>
    <Beseda>model calibration</Beseda>
    <Beseda>model validation</Beseda>
    <Beseda>add-my-pet</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>teorija dinamične enrgijske bilance</Beseda>
    <Beseda>bioenergetika</Beseda>
    <Beseda>razvoj modelov</Beseda>
    <Beseda>kalibracija modelov</Beseda>
    <Beseda>dobre modelarske prakse</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="" DRIVER="info:eu-repo/semantics/other">Neznano</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2026-07-08 17:12:34</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2026-07-08 17:12:34</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2026-07-09 03:57:03</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2026</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba>Soavtorji: Anna Sulc, Eline Le Moan, Elisa Donati, Evridiki Klagkou, María-José Lagunes, Urban Dajčman, Tjui Yeuw Tan;
</Opomba>
  <StStrani>str. 1-20</StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>[article no.] 111703</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2>Vol. 521</StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>2026</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>2026-06-24</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="6" Kratica="CC BY 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl" Logo="by.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/licence/by.png" DatumZacetkaLicenciranja="" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="32845" Ime="Diogo F." Priimek="Oliveira" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="474239747" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="32846" Ime="Anna" Priimek="Sulc" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="474240259" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="32847" Ime="Eline" Priimek="Le Moan" AltIme="Eline Le Moan" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="474240515" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="17561" Ime="Urban" Priimek="Dajčman" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="270763619" Afiliacija="" ArrsID="55809" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">57.01:51</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">0304-3800</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolmodel.2026.111703">10.1016/j.ecolmodel.2026.111703</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/283468547">283468547</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="47537" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="html.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/html.gif" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2026-07-08 17:12:38" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304380026002310?via%3Dihub</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>74c1a9a5-7adf-11f1-b663-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=47537</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="47538" DatotekaNRID="14733362" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/pdf.gif" VelikostDatoteke="3032701" VelikostDatotekeKratko="2,89 MB" DatumVstavljanja="2026-07-08 17:13:29" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv>RAZ_Oliveira_Diogo_F._2026.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Oliveira_Diogo_F._2026.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>F401750078C6A615D91E972C06DDB5F9</MD5>
      <SHA256>4544bec7d1956f3b73980fbc679c37d31673e0c0d57321af8f8d08a346fce945</SHA256>
      <UUID>935b12e7-7adf-11f1-b663-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=47538</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="144206"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="32" Kratica="NIB" ZavodEvsID="3200320" Logo="nib.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/logo/nib.png">Nacionalni inštitut za biologijo</Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P1-0255-2017" Stevilka="P1-0255-2017" Naslov="Združbe, interakcije in komunikacije v ekosistemih" Akronim="" Delez="17"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/other//PhD%20research%20funding" Stevilka="PhD research funding" Naslov="Javna agencija za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost Republike Slovenije" Akronim="ARIS" Delez="17"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ANR/French National Research Agency (ANR)/ANR-22-SARG-0003" Stevilka="ANR-22-SARG-0003" Naslov="BIOenergetic Modeling Approach for Sargassum dynamics" Akronim="BIOMAS" Delez="17"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/FCT//LA%2FP%2F0079%2F2020" Stevilka="LA/P/0079/2020" Naslov="Associate Laboratory of Energy, Transports and Aerospace." Akronim="LAETA" Delez="17"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/EC//101155091" Stevilka="101155091" Naslov="Investigating the consequences of birth by Caesarean Section in hypothalamic and Amygdalar neuroVAscular deveLOpmeNt" Akronim="AVALON" Delez="17"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ANR/French National Research Agency (ANR)/ANR-17-EURE-0015" Stevilka="ANR-17-EURE-0015" Naslov="Interdisciplinary Graduate School for the Blue planet" Akronim="ISBlue" Delez="17"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
