<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="29330" NadgradivoID="0" NRID="28564371" OceID="0" DomainUrl="https://dirros.openscience.si/" IzpisPolniUrl="https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=29330" StOgledov="29" StPrenosov="20" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-05-09 07:46:46" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/DiRROS-29330">20.500.12556/DiRROS-29330</PID>
  <Naslov>Environmental DNA Metabarcoding of Cephalopod Diversity in the Tyrrhenian Deep Sea</Naslov>
  <Podnaslov>version v 1.0</Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>This dataset contains the raw demultiplexed reads of the study &quot;Environmental Metabarcoding of Cephalopod Diversity in the Tyrrhenian Deep Sea&quot;. eDNA was extracted from water (wat) and sediment (sed) matrices, amplified with Ceph18S primers that specifically target cephalopods (de Jonge et al. 2021), and sequenced on IonTorrent platform. The names of the files indicate the sampling station (ST1, ST4, ST5, ST6), the replicate number (R1, R2), and the environmental matrix (wat, sed).</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>eDNA metabarcoding</Beseda>
    <Beseda>cephalopod assemblages</Beseda>
    <Beseda>deep-sea biodiversity</Beseda>
    <Beseda>Dohrn canyo</Beseda>
    <Beseda>environmental matrices</Beseda>
    <Beseda>reference databases</Beseda>
    <Beseda>Tyrrhenian deep sea</Beseda>
    <Beseda>Mediterranean deep sea</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>okoljska DNK</Beseda>
    <Beseda>eDNK metabarkodiranje</Beseda>
    <Beseda>glavonožci</Beseda>
    <Beseda>morska biologija</Beseda>
    <Beseda>globokomorski kanjoni</Beseda>
    <Beseda>okoljske matrice</Beseda>
    <Beseda>referenčne baze podatkov</Beseda>
    <Beseda>Tirensko globoko morje</Beseda>
    <Beseda>Sredozemsko globoko morje</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>false</JeRecenzirano>
  <Zaloznik>Zenodo</Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="" DRIVER="info:eu-repo/semantics/other">Neznano</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2026-05-08 13:55:49</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2026-05-08 14:00:20</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2026-05-09 03:44:21</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2025</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida>Genève</KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba>Nasl. z. nasl. zaslona;
Opis vira z dne 5. 4. 2026;
Soavtorji: Alex Cussigh, Valentina Crobe, Martina Spiga, Alice Ferrari, Alessia Cariani, Federica Piattoni, Federica Costantini, Silvia Franzellitti, Alberto Pallavicini, David Stanković, and Sergio Stefanni;
</Opomba>
  <StStrani>1 spletni vir</StStrani>
  <StevilcenjeNivo1></StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2></StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija></Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>2025-03-30</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="6" Kratica="CC BY 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl" Logo="by.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/licence/by.png" DatumZacetkaLicenciranja="" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="17920" Ime="Martina" Priimek="La Torre" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="450262531" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="17921" Ime="Alex" Priimek="Cussigh" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="450262787" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="17922" Ime="Valentina" Priimek="Crobe" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="450263043" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="17923" Ime="Martina" Priimek="Spiga" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="450263299" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="17924" Ime="Alice" Priimek="Ferrari" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="450263555" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="17925" Ime="Alessia" Priimek="Cariani" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="64365923" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="17926" Ime="Federica" Priimek="Piattoni" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="450264323" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="17927" Ime="Federica" Priimek="Costantini" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="450264067" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="17928" Ime="Silvia" Priimek="Franzellitti" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="450263811" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="9580" Ime="Alberto" Priimek="Pallavicini" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="222521955" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="5543" Ime="David" Priimek="Stanković" AltIme="D. Stanković; David Stankovic; D. Stankovic" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="128166499" Afiliacija="" ArrsID="33151" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="15852" Ime="Sergio" Priimek="Stefanni" AltIme="S. Stefanni" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="290359395" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">574.5</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/274268931">274268931</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="43909" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="html.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/html.gif" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2026-05-08 13:55:54" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://zenodo.org/records/13759423</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>dde8a025-4ad4-11f1-8a5a-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=43909</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="43910" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="7" NamenDatoteke="Raziskovalni podatki" FormatDatotekeID="4" FormatDatoteke=".zip" MIME="application/zip" IkonaFormata="zip.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/zip.gif" VelikostDatoteke="11734325" VelikostDatotekeKratko="11,19 MB" DatumVstavljanja="2026-05-08 13:56:46" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv>RAZ_La_Torre_Martina_2025.zip</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_La_Torre_Martina_2025.zip</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>866856EAB40357987ECA113BF3AC7787</MD5>
      <SHA256>41553c7d5c7bd72e89e70f8efc7c081bb7a0ec4e31066fa32bfa22acbe42ad1a</SHA256>
      <UUID>fd3ff504-4ad4-11f1-8a5a-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=43910</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="43911" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="27" NamenDatoteke="Metapodatki" FormatDatotekeID="1" FormatDatoteke=".json" MIME="application/octet-stream" IkonaFormata="ostalo.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/ostalo.gif" VelikostDatoteke="8467" VelikostDatotekeKratko="8,27 KB" DatumVstavljanja="2026-05-08 13:57:05" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="2">
      <Naziv>RAZ_La_Torre_Martina_2025.json</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_La_Torre_Martina_2025.json</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>61C8C638B4C154DD5B7C4F8CDD5AACB5</MD5>
      <SHA256>c7afa878613ede12a68571dbef8dc6f1041905a79b4db3e4e2f9195c67641053</SHA256>
      <UUID>08806b16-4ad5-11f1-8a5a-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=43911</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="43912" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="4" NamenDatoteke="Sorodno delo" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="html.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/html.gif" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2026-05-08 13:59:17" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="4">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://doi.org/10.3390/jmse12111897</URL>
      <Opis>Znanstveni članek</Opis>
      <OpisTujJezik>Research article</OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>0</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>57615032-4ad5-11f1-8a5a-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=43912</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="32" Kratica="NIB" ZavodEvsID="3200320" Logo="nib.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/logo/nib.png">Nacionalni inštitut za biologijo</Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="2.20" Koda="2.20" Naziv="Zaključena znanstvena zbirka raziskovalnih podatkov" SchemaOrg="DataSet"></TipologijaDela>
  <Podgradiva>
    <Potomci>
    </Potomci>
    <Starsi>
      <Gradivo ID="20620" NRID="25381249" Zaporedje="1" JeZaklenjeno="false" JePotrjeno="true">Environmental DNA metabarcoding of cephalopod diversity in the Tyrrhenian deep sea</Gradivo>
    </Starsi>
  </Podgradiva>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
