<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="29004" NadgradivoID="1603" NRID="28448160" OceID="0" DomainUrl="https://dirros.openscience.si/" IzpisPolniUrl="https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=29004" StOgledov="35" StPrenosov="19" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-04-17 08:04:40" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/DiRROS-29004">20.500.12556/DiRROS-29004</PID>
  <Naslov>Genetic diversity of Campylobacter concisus isolates from Slovenian patients with infectious diarrhoea</Naslov>
  <Podnaslov></Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>Campylobacter concisus is recognized as a potential pathogen in gastrointestinal diseases, particularly in patients with chronic intestinal diseases. This study investigates the genomic characteristics, phylogenetic distribution, virulence factors, resistance genes and presence of plasmids in C. concisus isolates from Slovenian patients with community-acquired infectious diarrhoea. Prospectively collected isolates were analysed using whole-genome sequencing (WGS). WGS analysis revealed substantial genetic diversity among isolates, with distinct differences observed between two genomospecies (GS1, GS2). GS1 isolates had smaller genomes, lower GC content, and fewer coding regions than GS2 isolates. Multilocus sequence typing confirmed a high degree of genetic diversity, with most isolates belonging to novel sequence types. Plasmids, including pSma1 and pICON, were more prevalent in GS2 isolates. The virulence factors Zot and Exo9 toxins were detected in both genomospecies, with Zot predominantly found in GS1 and Exo9 in GS2. The T6 secretion system was prevalent in both groups, whereas the T4SS was less frequently observed. The combination of the T6SS, plasmids, and toxins suggests a complex mechanism of pathogenicity. This study highlights the high genetic diversity of C. concisus and provides new insights into its genomic features and virulence factors. The presence of plasmids and secretion systems, particularly the T6SS, underscores the potential of C. concisus for adaptation and pathogenicity.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>Campylobacter concisus</Beseda>
    <Beseda>WGS</Beseda>
    <Beseda>virulence factors</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>faktor virulence</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="" DRIVER="info:eu-repo/semantics/other">Neznano</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2026-04-16 11:37:52</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2026-04-16 11:37:52</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2026-04-17 03:55:05</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2025</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba>Nasl. z nasl. zaslona;
Opis vira z dne 5. 2. 2026;
</Opomba>
  <StStrani>str. 1-15</StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>iss. 1, [article no.] 87</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2>Vol. 14</StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>Dec. 2025</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>0000-00-00</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="6" Kratica="CC BY 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl" Logo="by.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/licence/by.png" DatumZacetkaLicenciranja="" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="1490" Ime="Romina" Priimek="Kofol" AltIme="R. Kofol" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="122994019" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="27281" Ime="Mateja" Priimek="Pirš" AltIme="M Pirš; M. Pirsh; Mateja Pirs; M. Pirs" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="43006051" Afiliacija="" ArrsID="31399" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="4865" Ime="Tadeja" Priimek="Kotar" AltIme="T. Kotar; T Kotar" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="42084451" Afiliacija="" ArrsID="24094" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="8916" Ime="Tatjana" Priimek="Lejko-Zupanc" AltIme="Tatjana Lejko- Zupanc; Tatjana Lejko Zupanc; T. Lejko-Zupanc; T. Zupanc- Lejko; T. Lejko- Zupanc; T Lejko Zupanc; T Zupanc Lejko; T Lejko Zupanc; T. Lejko; Tatjana Lejko Zupanc; Tatjana Lejko Zupan; Tatjana Lejko Zupan" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="3473507" Afiliacija="" ArrsID="11330" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="22805" Ime="Andraž" Priimek="Celar Šturm" AltIme="Andraž Celar Šturm; A. Celar Šturm; A. Celar Šturm" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="292992355" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="9032" Ime="Andreja" Priimek="Kukec" AltIme="A. Kukec; A Kukec" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="103310691" Afiliacija="" ArrsID="30640" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="29847" Ime="Tadeja" Priimek="Matos" AltIme="T. Matos; T Matos" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="4724067" Afiliacija="" ArrsID="18993" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="22807" Ime="Tina" Priimek="Triglav" AltIme="Tina K. Triglav; T. Triglav; Tina Korać; T. Korac" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="242073955" Afiliacija="" ArrsID="54478" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">616.9:579</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">2076-2607</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.3390/microorganisms14010087">10.3390/microorganisms14010087</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/267496195">267496195</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="43298" DatotekaNRID="14654447" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/pdf.gif" VelikostDatoteke="2339514" VelikostDatotekeKratko="2,23 MB" DatumVstavljanja="2026-04-16 11:38:38" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv>RAZ_Kofol_Romina_2025.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Kofol_Romina_2025.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>B3070D0E0D3AE81B5054C221B64ECC55</MD5>
      <SHA256>b41260b7e083ddc3b491c413607ffe0235bc99940b674cae8b3bbb7a77fb576f</SHA256>
      <UUID>0c4590fa-3978-11f1-9cc3-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=43298</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="51901"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="43297" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="html.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/html.gif" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2026-04-16 11:37:54" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://www.mdpi.com/2076-2607/14/1/87</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>f195355c-3977-11f1-9cc3-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=43297</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="66" Kratica="UKC LJ" ZavodEvsID="" Logo="ukclj.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/logo/ukclj.png">Univerzitetni klinični center Ljubljana</Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P3-0083-2022" Stevilka="P3-0083-2022" Naslov="Odnosi parazitskega obstajanja" Akronim="" Delez="100"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
