<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="27947" NadgradivoID="359" NRID="28225106" OceID="0" DomainUrl="https://dirros.openscience.si/" IzpisPolniUrl="https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=27947" StOgledov="221" StPrenosov="139" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-05-01 17:38:32" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/DiRROS-27947">20.500.12556/DiRROS-27947</PID>
  <Naslov>Exploring the genetic diversity of recent Ralstonia pseudosolanacearum phylotype I findings in Europe</Naslov>
  <Podnaslov></Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>The increasing prevalence of Ralstonia pseudosolanacearum phylotype I (phy I) in agricultural regions across Europe highlights the need for heightened awareness and preventive measures. Recent detections in multiple European countries span a range of agricultural systems, host plants, and natural aquatic environments. These findings have been linked either to infected plant material at import (interceptions) or to plants cultivated in specific European regions, often after importation of infected plant material. To investigate the genetic diversity of these emerging populations, we analysed whole-genome sequence (WGS) data from a collection of 62 R. pseudosolanacearum phy I isolates, including those recently obtained in various European countries, using average nucleotide analysis (ANI) and core genome multilocus sequence typing (cgMLST). ANI analysis revealed two distinct major clades: the &quot;rose clade&quot;, comprising isolates from rose, potato, surface water, and bittersweet, most closely matching with sequevar 33, and the &quot;major ginger clade&quot;, including isolates from members of the Zingiberaceae family, with the best match to sequevar 30. Additionally, several minor clades of Zingiberaceae isolates and a &quot;tomato clade” (most closely related to sequevar 18) were identified. Pathogenicity assays with high inoculation titers were performed on tomato to assess the biological relevance of the observed genetic diversity. Our findings suggest multiple independent introduction events of virulent R. pseudosolanacearum phy I populations into Europe between 2015 and 2024. Given the genetic variability of the introduced bacterial isolates, the pathogen’s ability to systemically infect a broad range of host plants which can differ per isolate, and its persistence in diverse agricultural and environmental niches, the implementation of stringent import control measures for plant material entering the European Union is strongly recommended.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>Ralstonia pseudosolanacearum</Beseda>
    <Beseda>surface water</Beseda>
    <Beseda>Zingiberaceae</Beseda>
    <Beseda>Solanaceae</Beseda>
    <Beseda>Rosaceae</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>Ralstonia pseudosolanacearum</Beseda>
    <Beseda>površinska voda</Beseda>
    <Beseda>Zingiberaceae</Beseda>
    <Beseda>Solanaceae</Beseda>
    <Beseda>Rosaceae</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="" DRIVER="info:eu-repo/semantics/other">Neznano</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2026-03-02 09:24:23</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2026-03-02 09:24:23</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2026-03-03 03:52:35</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2026</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba>Avtorji: Maria Bergsma-Vlami, Eva Fornefeld, Rene Glenz, Anna Kołodziejska, Francesca Giacobbi, Rossella Gozzi, Stefania Loreti, Ágnes Ambrus, D. Hederics, Christophe Debonneville, Tanja Dreo, Manca Pirc, Aleksander Benčič, Jolien Venneman, Johan Van Vaerenbergh, Steve Baeyen, Maria Holeva, P.E. Glynos, Robert Vreeburg, Tijs van den Bosch, Chiel Pel, Tom Raaymakers;
</Opomba>
  <StStrani>str. [1-15]</StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>Vol. </StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2></StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>2026</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>2026-02-10</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="1" Kratica="CC BY-NC-ND 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl" Logo="by-nc-nd.eu.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/licence/by-nc-nd.eu.png" DatumZacetkaLicenciranja="" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="28039" Ime="Maria" Priimek="Bergsma-Vlami" AltIme="Maria Bergsma- Vlami; M. Bergsma-Vlami; M. Bergsma- Vlami" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="283815011" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="28040" Ime="Eva" Priimek="Fornefeld" AltIme="E. Fornefeld" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="390204419" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="28041" Ime="Rene" Priimek="Glenz" AltIme="R. Glenz" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="468970243" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="28042" Ime="Anna" Priimek="Kołodziejska" AltIme="A. Kołodziejska" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="468970755" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="28043" Ime="Francesca" Priimek="Giacobbi" AltIme="F. Giacobbi" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="468971011" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1994" Ime="Tanja" Priimek="Dreo" AltIme="T. Dreo; T Dreo; Tanja Drev; Tanya Dreo" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="6536547" Afiliacija="" ArrsID="23611" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="2001" Ime="Manca" Priimek="Pirc" AltIme="Manca Zupančič; M. Pirc; M Pirc" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="14887267" Afiliacija="" ArrsID="24505" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="16472" Ime="Aleksander" Priimek="Benčič" AltIme="Aleksander Bencic; Aleksander Ben?I?" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="258145379" Afiliacija="" ArrsID="52760" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">632.4:579.8</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">0929-1873</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.1007/s10658-026-03191-9">10.1007/s10658-026-03191-9</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/268258051">268258051</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="41167" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="html.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/html.gif" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2026-03-02 09:24:27" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://link.springer.com/article/10.1007/s10658-026-03191-9</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>3a55bddc-1611-11f1-8c73-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=41167</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="41168" DatotekaNRID="14603064" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/pdf.gif" VelikostDatoteke="1852509" VelikostDatotekeKratko="1,77 MB" DatumVstavljanja="2026-03-02 09:26:56" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv>RAZ_Bergsma-Vlami_Maria_2026.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Bergsma-Vlami_Maria_2026.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>E7C4F26CC562F7470AAAE0CEC8DCA13B</MD5>
      <SHA256>24b78ac4bb9b0786798455f03f081111fefc87b31d207d9b440fb31887db1fb7</SHA256>
      <UUID>9379029a-1611-11f1-8c73-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=41168</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="59306"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="32" Kratica="NIB" ZavodEvsID="3200320" Logo="nib.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/logo/nib.png">Nacionalni inštitut za biologijo</Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P4-0165-2022" Stevilka="P4-0165-2022" Naslov="Biotehnologija in sistemska biologija rastlin" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/Ministry%20of%20Agriculture%2C%20Forestry%20and%20Food%2C%20Slovenia/Euphresco/2023-F-431" Stevilka="2023-F-431" Naslov="Professional Tasks Programme in the Field of Plant Health" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
