<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="20575" NadgradivoID="524" NRID="25378448" OceID="0" DomainUrl="https://dirros.openscience.si/" IzpisPolniUrl="https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=20575" StOgledov="1355" StPrenosov="1455" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-05-03 11:51:57" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/DiRROS-20575">20.500.12556/DiRROS-20575</PID>
  <Naslov>Discovery of novel and known viruses associated with toxigenic and non-toxigenic bloom forming diatoms from the Northern Adriatic Sea</Naslov>
  <Podnaslov></Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>Algal blooms impact trophic interactions, community structure and element fluxes. Despite playing an important role in the demise of phytoplankton blooms, only few viruses infecting diatoms have been cultured. Pseudo-nitzschia is a widespread diatom genus that commonly blooms in coastal waters and contains toxin-producing species. This study describes the characterization of a novel virus infecting the toxigenic species Pseudo-nitzschia galaxiae isolated from the northern Adriatic Sea. The ssRNA virus PnGalRNAV has 29.5 nm ± 1.2 nm icosahedral virions and a genome size of 8.8 kb. It belongs to the picorna-like Marnaviridae family and shows high specificity for P. galaxiae infecting two genetically and morphologically distinct strains. We found two genetically distinct types of this virus and screening of the global virome database revealed matching sequences from the Mediterranean region and China, suggesting its global distribution. Another virus of similar shape and size infecting Pseudo-nitzschia calliantha was found, but its genome could not be determined. In addition, we have obtained and characterized a new virus that infects Chaetoceros tenuissimus. The replicase protein of this virus is very similar to the previously described ChTenDNAV type-II virus, but it has a unique genome and infection pattern. Our study is an important contribution to the collective diatom virus culture collection and will allow further investigation into how these viruses control diatom bloom termination, carbon export and toxin release in the case of Pseudo-nitzschia.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>algal blooms</Beseda>
    <Beseda>diatoms</Beseda>
    <Beseda>virus</Beseda>
    <Beseda>PnGalRNAV</Beseda>
    <Beseda>genome</Beseda>
    <Beseda>Adriatic Sea</Beseda>
    <Beseda>marine virology</Beseda>
    <Beseda>phytoplankton ecology</Beseda>
    <Beseda>marine biology</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>cvetenje alg</Beseda>
    <Beseda>diatomeje</Beseda>
    <Beseda>virus</Beseda>
    <Beseda>genom</Beseda>
    <Beseda>Jadransko morje</Beseda>
    <Beseda>morska virologija</Beseda>
    <Beseda>ekologija fitoplanktona</Beseda>
    <Beseda>morska biologija</Beseda>
    <Beseda>Pseudo-nitzschia</Beseda>
    <Beseda>Chaetoceros</Beseda>
    <Beseda>Marnaviridae</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="" DRIVER="info:eu-repo/semantics/other">Neznano</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2024-10-23 13:12:54</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2024-10-23 13:12:55</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2024-11-06 04:03:33</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2024</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba>Ostali soavtorji: Denis Kutnjak, Ion Gutierrez-Aguirre, Corina P. D. Brussaard, Katarina Bačnik;
Online first: 15 Oct. 2024;
Članek v PDF formatu obsega 44 str.;
</Opomba>
  <StStrani></StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>[Art. no.] ǂ102737</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2></StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>2024</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>2024-11-01</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="1" Kratica="CC BY-NC-ND 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl" Logo="by-nc-nd.eu.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/licence/by-nc-nd.eu.png" DatumZacetkaLicenciranja="" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="8135" Ime="Timotej" Priimek="Turk Dermastia" AltIme="Timotej Turk Dermastia; Timotej Dermastia Turk; Timotej Dermastia Turk" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="83853411" Afiliacija="" ArrsID="39120" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="9655" Ime="Denis" Priimek="Kutnjak" AltIme="D. Kutnjak; D. Kutjnak" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="223943779" Afiliacija="" ArrsID="35384" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1618" Ime="Ion" Priimek="Gutiérrez-Aguirre" AltIme="Ion Gutierrez- Aguirre; Ion Gutierrez-Aguirre; I. Gutiérrez-Aguirre; I. Gutierrez; I Gutierrez-Aguirre; I Gutierrez- Aguirre; Ion Gutierrez Aquirre; Ion Gutierrez Aquirre; Ion Gutiérrez-Aguire; Ion Gutierrez Aguirra; Ion Gutierrez Aguirra; Jon Gutierrez Aguirre; Jon Gutierrez Aguirre" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="53769571" Afiliacija="" ArrsID="27827" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="17886" Ime="Corina P. D." Priimek="Brussaard" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="450232323" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="9608" Ime="Katarina" Priimek="Bačnik" AltIme="Katarina Bacnik; K. Bačnik" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="235891299" Afiliacija="" ArrsID="50563" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">574</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">1568-9883</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.1016/j.hal.2024.102737">10.1016/j.hal.2024.102737</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/212651523">212651523</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="29030" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="html.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/html.gif" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2024-10-23 13:12:58" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://doi.org/10.1016/j.hal.2024.102737</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>c2777578-912f-11ef-89f3-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=29030</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="29306" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/pdf.gif" VelikostDatoteke="8779229" VelikostDatotekeKratko="8,37 MB" DatumVstavljanja="2024-11-05 11:26:52" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv>RAZ_Turk_Dermastia_Timotej_2024.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Turk_Dermastia_Timotej_2024.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>2A4C7BD4E5DD28A34A4591CBBB6FE0FB</MD5>
      <SHA256>6d823495580723516bf2d9005ff5562b6fe1f0a0139165f59449831d1fa9dbc3</SHA256>
      <UUID>796f409a-9b60-11ef-89f3-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=29306</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="83502"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="32" Kratica="NIB" ZavodEvsID="3200320" Logo="nib.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/logo/nib.png">Nacionalni inštitut za biologijo</Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P1-0237-2020" Stevilka="P1-0237-2020" Naslov="Raziskave obalnega morja" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P4-0407-2019" Stevilka="P4-0407-2019" Naslov="Okoljska in aplikativna virologija: virusi, prijatelji in sovražniki" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P4-0165-2022" Stevilka="P4-0165-2022" Naslov="Biotehnologija in sistemska biologija rastlin" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS/postdoctoral grant/01Z14396" Stevilka="01Z14396" Naslov="" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/EC/FP7/211372" Stevilka="211372" Naslov="Life Watch" Akronim="LIFEWATCH" Delez="0"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
