<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="19501" NadgradivoID="1611" NRID="24549651" OceID="0" DomainUrl="https://dirros.openscience.si/" IzpisPolniUrl="https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=19501" StOgledov="1923" StPrenosov="843" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-05-01 09:29:28" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/DiRROS-19501">20.500.12556/DiRROS-19501</PID>
  <Naslov>A mini-TGA protein modulates gene expression through heterogeneous association with transcription factors</Naslov>
  <Podnaslov></Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>TGA (TGACG-binding) transcription factors, which bind their target DNA through a conserved basic region leucine zipper (bZIP) domain, are vital regulators of gene expression in salicylic acid (SA)-mediated plant immunity. Here, we investigated the role of StTGA2.1, a potato (Solanum tuberosum) TGA lacking the full bZIP, which we named a mini-TGA. Such truncated proteins have been widely assigned as loss-of-function mutants. We, however, confirmed that StTGA2.1 overexpression compensates for SA-deficiency, indicating a distinct mechanism of action compared with model plant species. To understand the underlying mechanisms, we showed that StTGA2.1 can physically interact with StTGA2.2 and StTGA2.3, while its interaction with DNA was not detected. We investigated the changes in transcriptional regulation due to StTGA2.1 overexpression, identifying direct and indirect target genes. Using in planta transactivation assays, we confirmed that StTGA2.1 interacts with StTGA2.3 to activate StPRX07, a member of class III peroxidases (StPRX), which are known to play role in immune response. Finally, via structural modeling and molecular dynamics simulations, we hypothesized that the compact molecular architecture of StTGA2.1 distorts DNA conformation upon heterodimer binding to enable transcriptional activation. This study demonstrates how protein truncation can lead to distinct functions and that such events should be studied carefully in other protein families.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>proteini mini-TGA</Beseda>
    <Beseda>rastlinski imunski odziv</Beseda>
    <Beseda>transkripcijski faktorji TGA</Beseda>
    <Beseda>virus krompirja Y</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik></Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1060" ISO639-3="slv">Slovenski jezik</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="" DRIVER="info:eu-repo/semantics/other">Neznano</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2024-07-18 14:15:07</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2024-07-18 14:15:07</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2024-07-19 03:45:50</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2022</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba>Ostali avtorji: Marko Petek, Tjaša Lukan, Karmen Pogačar, Katja Stare, Erica Teixeira Prates, Daniel A Jacobson, Jan Zrimec, Gregor Bajc, Matej Butala, Maruša Pompe Novak, Quentin Dudley, Nicola Patron, Ajda Taler-Verčič, Aleksandra Usenik, Dušan Turk, Salomé Prat, Anna Coll, Kristina Gruden;
</Opomba>
  <StStrani>str. 1934–1952</StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>iss. 3</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2>Vol. 191</StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>Mar. 2023</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>2023-03-01</DatumObjaveClanka>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="7019" Ime="Špela" Priimek="Tomaž" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="251792739" Afiliacija="" ArrsID="50566" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1866" Ime="Marko" Priimek="Petek" AltIme="M. Petek; M. Peter" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="125790563" Afiliacija="" ArrsID="29617" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="9821" Ime="Tjaša" Priimek="Lukan" AltIme="T. Lukan; Tjasa Lukan" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="236935011" Afiliacija="" ArrsID="36323" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="16084" Ime="Karmen" Priimek="Pogačar" AltIme="K. Pogačar" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="293655395" Afiliacija="" ArrsID="54306" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1802" Ime="Katja" Priimek="Stare" AltIme="Katja Barle; K. Stare" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="125532771" Afiliacija="" ArrsID="29635" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="16332" Ime="Erica" Priimek="Teixeira Prates" AltIme="Erica Teixeira Prates" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="420838915" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="16333" Ime="Daniel A." Priimek="Jacobson" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="420839171" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="15215" Ime="Jan" Priimek="Zrimec" AltIme="J. Zrimec" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="165559395" Afiliacija="" ArrsID="32446" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="16025" Ime="Gregor" Priimek="Bajc" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="120308067" Afiliacija="" ArrsID="30435" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="9739" Ime="Matej" Priimek="Butala" AltIme="M. Butala" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="16823139" Afiliacija="" ArrsID="24290" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1714" Ime="Maruša" Priimek="Pompe Novak" AltIme="Maruša Pompe; Maruša Pompe Novak; Maruša Pompe-Novak; Maruša Pompe- Novak; M. Pombe; Marusa Pompe Novak; Marusa Pompe Novak; M. Pompe Novak; M. Pompe Novak; M. P. Novak" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="4640867" Afiliacija="" ArrsID="18467" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1811" Ime="Ajda" Priimek="Taler-Verčič" AltIme="Ajda Taler- Verčič; Ajda Taler; Ajda Taler Verčič; Ajda Taler Verčič; A Taler-Verčič; A Taler- Verčič; A. Taler-Verčič; A. Taler- Verčič; A. Taler-Vercic; A. Taler- Vercic; Ajda Ajda Taler-Verčič; Ajda Ajda Taler- Verčič" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="126622307" Afiliacija="" ArrsID="29544" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="16334" Ime="Aleksandra" Priimek="Usenik" AltIme="Saša Usenik; A. Usenik" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="64847459" Afiliacija="" ArrsID="26515" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="2469" Ime="Dušan" Priimek="Turk" AltIme="D. Turk; Dusan Turk; D Turk" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="2348387" Afiliacija="" ArrsID="04988" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="5029" Ime="Anna" Priimek="Coll Rius" AltIme="Anna Coll; A. Coll; Ana Coll" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="206279779" Afiliacija="" ArrsID="34130" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1484" Ime="Kristina" Priimek="Gruden" AltIme="Kristina Gruden Gričar; Kristina Gruden Gričar; K. Gruden; Krtistina Gruden" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="3734115" Afiliacija="" ArrsID="12688" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">578</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">0032-0889</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.1093/plphys/kiac579">10.1093/plphys/kiac579</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/135092739">135092739</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="26912" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="html.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/html.gif" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2024-07-18 14:15:11" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://doi.org/10.1093/plphys/kiac579</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID>9d512494-44ee-11ef-b487-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=26912</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="26913" DatotekaNRID="13844088" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/pdf.gif" VelikostDatoteke="1439016" VelikostDatotekeKratko="1,37 MB" DatumVstavljanja="2024-07-18 14:26:21" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv>RAZ_Tomaz_Spela_2022.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Tomaz_Spela_2022.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>7E5CE539ECE1AFFC607A26125B8999D4</MD5>
      <SHA256>bca4be0bc6d2b99a4bc16e3c7bdf1415302bd5ee20374d4611667df6f0ef14db</SHA256>
      <UUID>2c98e4a9-44f0-11ef-b487-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=26913</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="95633"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="32" Kratica="NIB" ZavodEvsID="3200320" Logo="nib.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/logo/nib.png">Nacionalni inštitut za biologijo</Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P4-0165" Stevilka="P4-0165" Naslov="Biotehnologija in sistemska biologija rastlin" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//J4-1777" Stevilka="J4-1777" Naslov="Odkrivanje mehanizmov učinkovitosti in specifičnosti imunske signalizacije v krompirju z inovativnim pridobivanjem podatkov in modeliranjem" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//J1-2467" Stevilka="J1-2467" Naslov="Odkrivanje dinamike omrežja v interakciji krompirjev virus Y-rastlinska celica" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/862858" Stevilka="862858" Naslov="Accelerated Development of multiple-stress tolerAnt PoTato" Akronim="ADAPT" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="" Stevilka="" Naslov="" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/other/US Department of Energy/DE-AC05-00OR22725" Stevilka="DE-AC05-00OR22725" Naslov="" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
