<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<Gradivo ID="11205" NadgradivoID="524" NRID="11446227" OceID="0" DomainUrl="https://dirros.openscience.si/" IzpisPolniUrl="https://dirros.openscience.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&amp;id=11205" StOgledov="4859" StPrenosov="1713" StOcen="0" VsotaOcen="0" DatumIzvoza="2026-05-13 10:44:47" OcenaSkupna="0" StPodgradiv="0" StudijskiProgramEvsID="" JeIndeksirano="0" JeVecAvtorjev="0" DovoliZahtevkeZaDostop="0">
  <PID Url="http://hdl.handle.net/20.500.12556/DiRROS-11205">20.500.12556/DiRROS-11205</PID>
  <Naslov>Ecological time series and integrative taxonomy unveil seasonality and diversity of the toxic diatom Pseudo-nitzschia H. Peragallo in the northern Adriatic Sea</Naslov>
  <Podnaslov></Podnaslov>
  <TujJezik_Naslov></TujJezik_Naslov>
  <TujJezik_Podnaslov></TujJezik_Podnaslov>
  <Opis>Pseudo-nitzschia H. Peragallo (1900) is a globally distributed genus of pennate diatoms that are important components of phytoplankton communities worldwide. Some members of the genus produce the neurotoxin domoic acid, so regular monitoring is in place. However, the identification of toxic members in routine samplings remains problematic. In this study, the diversity and seasonal occurrence of Pseudo-nitzschia species were investigated in the Gulf of Trieste, a shallow gulf in the northern Adriatic Sea. We used time series data from 2005 to 2018 to describe the seasonal and inter-annual occurrence of the genus in the area and its contribution to the phytoplankton community. On average, the genus accounted for about 15 % of total diatom abundance and peaked in spring and autumn, with occasional outbreaks during summer and large inter-annual fluctuations. Increased water temperature and decreased salinity positively affected the presence of some members of the genus, while strong effects could be masked by an unsuitable definition of the species complexes used for monitoring purposes. Therefore, combining morphological (TEM) and molecular analyses by sequencing the ITS, 28S and rbcL markers, eight species were identified from 83 isolated monoclonal strains: P. calliantha, P. fraudulenta, P. delicatissima, P. galaxiae, P. mannii, P. multistriata, P. pungens and P. subfraudulenta. A genetic comparison between the isolated strains and other strains in the Mediterranean was carried out and rbcL was inspected as a potential barcode marker in respect to our results. This is the first study in the Gulf of Trieste on Pseudo-nitzschia time series from a long-term ecological research (LTER) site coupled with molecular data. We show that meaningful ecological conclusions can be drawn by applying integrative methodology, as opposed to the approach that only considers species complexes. The results of this work will provide guidance for further monitoring efforts as well as research activities, including population genetics and genomics, associated with seasonal distribution and toxicity profiles.</Opis>
  <TujJezik_Opis></TujJezik_Opis>
  <KljucneBesede>
    <Beseda>Pseudo-nitzschia</Beseda>
    <Beseda>morphology</Beseda>
    <Beseda>phylogeny</Beseda>
    <Beseda>seasonality</Beseda>
    <Beseda>time series</Beseda>
    <Beseda>Adriatic Sea</Beseda>
  </KljucneBesede>
  <TujJezik_KljucneBesede>
    <Beseda>ekologija</Beseda>
    <Beseda>morfologija</Beseda>
    <Beseda>filogenija</Beseda>
    <Beseda>Jadransko morje</Beseda>
  </TujJezik_KljucneBesede>
  <Potrjeno>true</Potrjeno>
  <JeZaklenjeno>false</JeZaklenjeno>
  <JeRecenzirano>true</JeRecenzirano>
  <Zaloznik>Elsevier</Zaloznik>
  <Izvor></Izvor>
  <Jezik ID="1033" ISO639-3="eng">Angleški jezik</Jezik>
  <TujJezik ID="1" ISO639-3="und">Ni določen</TujJezik>
  <Povezave></Povezave>
  <Pokrivanje></Pokrivanje>
  <CasovnoPokritje></CasovnoPokritje>
  <AvtorskePravice></AvtorskePravice>
  <VrstaGradiva ID="" DRIVER="info:eu-repo/semantics/other">Neznano</VrstaGradiva>
  <DatumVstavljanja>2020-03-18 16:47:50</DatumVstavljanja>
  <DatumObjave>2020-03-18 16:47:51</DatumObjave>
  <DatumSpremembe>2024-07-23 03:55:51</DatumSpremembe>
  <DatumTrajnegaHranjenja>0000-00-00 00:00:00</DatumTrajnegaHranjenja>
  <LetoIzida>2020</LetoIzida>
  <LetoIzidaDo>0</LetoIzidaDo>
  <KrajIzida></KrajIzida>
  <LetoIzvedbe>0</LetoIzvedbe>
  <KrajIzvedbe></KrajIzvedbe>
  <Opomba></Opomba>
  <StStrani>str. 1-20</StStrani>
  <StevilcenjeNivo1>101773</StevilcenjeNivo1>
  <StevilcenjeNivo2>Vol. 93</StevilcenjeNivo2>
  <Kronologija>Mar. 2020</Kronologija>
  <Patent_Stevilka></Patent_Stevilka>
  <Patent_DatumVeljavnosti>0000-00-00</Patent_DatumVeljavnosti>
  <VerzijaDokumenta>Zaloznikova</VerzijaDokumenta>
  <StatusObjaveDrugje>Objavljeno</StatusObjaveDrugje>
  <VrstaStroskaObjave>NiDoloceno</VrstaStroskaObjave>
  <DatumPoslanoVRecenzijo>0000-00-00</DatumPoslanoVRecenzijo>
  <DatumSprejetjaClanka>0000-00-00</DatumSprejetjaClanka>
  <DatumObjaveClanka>0000-00-00</DatumObjaveClanka>
  <Licence>
    <Licenca ID="1" Kratica="CC BY-NC-ND 4.0" Naziv="Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna" URL="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl" Logo="by-nc-nd.eu.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/licence/by-nc-nd.eu.png" DatumZacetkaLicenciranja="2020-03-18" VezanoNa="" VezanoNaAng="" Besedilo="" BesediloAng=""></Licenca>
  </Licence>
  <EmbargoDo></EmbargoDo>
  <VrstaEmbarga ID="1" Naziv="Takojšnja javna objava" OpenAIREDostop="openAccess"></VrstaEmbarga>
  <Osebe>
    <Oseba ID="8135" Ime="Timotej" Priimek="Turk Dermastia" AltIme="Timotej Turk Dermastia; Timotej Dermastia Turk; Timotej Dermastia Turk" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="83853411" Afiliacija="" ArrsID="39120" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="8136" Ime="Federica" Priimek="Cerino" AltIme="F. Cerino" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="270113635" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="5543" Ime="David" Priimek="Stanković" AltIme="D. Stanković; David Stankovic; D. Stankovic" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="128166499" Afiliacija="" ArrsID="33151" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1742" Ime="Janja" Priimek="Francé" AltIme="Janja France; J. Francé; Janja Francée; J. France" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="6218595" Afiliacija="" ArrsID="22617" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="247" Ime="Andreja" Priimek="Ramšak" AltIme="A. Ramšak" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="4205411" Afiliacija="" ArrsID="15367" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1762" Ime="Magda" Priimek="Tušek-Žnidarič" AltIme="Žnidarič Magda Tušek-; Magda Tušek Žnidarič; Magda Tušek- Žnidarič; Majda Tušek- Žnidarič; Mirjana Tušek- Žnidarič; Majda Tušek Žnidaršič; Majda Tušek- Žnidaršič; Majda Tušek-Žnidarič; Magda Tušek Žnidarič; Majda Tušek Žnidaršič; Magda TUŠEK; Magda Tusek-Snidari; M. Tusek Znidaric; M. Znidaric Tusek; M. Tusek Znidaric; M. Tušek Žnidarič; Magda Tusek Znidaric; Magda Tusek Znidaric; M. Tušek Žnidaršič; M. Tušek Žnidaršič; Magda Tušek Znidaric; Magda Tušek Znidaric; Magda Tušek-Žnidari; Magda Tušek- Žnidari; M. Tušek-Žnidarič; M. Tušek- Žnidarič; Magda T. Žnidarič; M. Tušek Žnidari?; Magda Tušek Žnidaršič; Magda Tušek Žnidaršič; Magda Tušek Žnidaric; Magda Tušek Žnidaric" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="3207523" Afiliacija="" ArrsID="09864" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="8137" Ime="Alfred" Priimek="Beran" AltIme="A. Beran" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="67620195" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="8138" Ime="Vanessa" Priimek="Natali" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="339931491" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="8139" Ime="Marina" Priimek="Cabrini" AltIme="" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="28738147" Afiliacija="" ArrsID="" ORCID=""></Oseba>
    <Oseba ID="1699" Ime="Patricija" Priimek="Mozetič" AltIme="Patricija Mozetic; P. Mozetič" VlogaID="70" VlogaNaziv="Avtor" ConorID="3479907" Afiliacija="" ArrsID="11360" ORCID=""></Oseba>
  </Osebe>
  <Identifikatorji>
    <Identifikator ID="4" Sifra="UDK" Naziv="UDK" URL="">574</Identifikator>
    <Identifikator ID="9" Sifra="ISSN-clanka" Naziv="ISSN pri članku" URL="">1568-9883</Identifikator>
    <Identifikator ID="15" Sifra="DOI" Naziv="DOI" URL="http://dx.doi.org/10.1016/j.hal.2020.101773">10.1016/j.hal.2020.101773</Identifikator>
    <Identifikator ID="3" Sifra="CobissID" Naziv="COBISS_ID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/40469253">40469253</Identifikator>
    <Identifikator ID="13" Sifra="OceCobissID" Naziv="OceCobissID" URL="https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/512209945">512209945</Identifikator>
  </Identifikatorji>
  <Datoteke>
    <Datoteka ID="13312" DatotekaNRID="0" NamenDatotekeID="5" NamenDatoteke="Izvorni URL" FormatDatotekeID="56" FormatDatoteke="URL" MIME="text/url" IkonaFormata="html.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/html.gif" VelikostDatoteke="0" VelikostDatotekeKratko="0,00 KB" DatumVstavljanja="2020-03-18 16:58:42" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="false" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="0">
      <Naziv></Naziv>
      <OrgNaziv></OrgNaziv>
      <URL>https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1568988320300536</URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5></MD5>
      <SHA256></SHA256>
      <UUID></UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=13312</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
    <Datoteka ID="27091" DatotekaNRID="13846490" NamenDatotekeID="2" NamenDatoteke="Predstavitvena datoteka" FormatDatotekeID="2" FormatDatoteke=".pdf" MIME="application/pdf" IkonaFormata="pdf.gif" IkonaFormataPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/fileTypes/pdf.gif" VelikostDatoteke="6917697" VelikostDatotekeKratko="6,60 MB" DatumVstavljanja="2024-07-22 12:26:35" JeZbrisana="false" JeJavnoVidna="true" JeIndeksirana="true" JeVidno="true" VidnoOd="01.01.1970" Zaporedje="1">
      <Naziv>RAZ_Turk_Dermastia_Timotej_2020.pdf</Naziv>
      <OrgNaziv>RAZ_Turk_Dermastia_Timotej_2020.pdf</OrgNaziv>
      <URL></URL>
      <Opis></Opis>
      <OpisTujJezik></OpisTujJezik>
      <UrlObdelave></UrlObdelave>
      <FrekvencaAzuriranjaID>1</FrekvencaAzuriranjaID>
      <Verzija></Verzija>
      <MD5>779357ADDF115E92933AF7F4B6C2D56C</MD5>
      <SHA256>49d439fc21627c2eefcf7c06d5ddaad287f7ad46d1365e9e0ed55ccf9b9be376</SHA256>
      <UUID>1b583b08-4804-11ef-b487-001a4af901a5</UUID>
      <PID></PID>
      <PrenosPolniUrl>https://dirros.openscience.si/Dokument.php?lang=slv&amp;id=27091</PrenosPolniUrl>
      <Vsebine>
        <Vsebina TipVsebine="GoloBesedilo" JezikID="1033" Oznaka="" Dolzina="106974"></Vsebina>
      </Vsebine>
    </Datoteka>
  </Datoteke>
  <Organizacije>
    <Organizacija OrganizacijaID="32" Kratica="NIB" ZavodEvsID="3200320" Logo="nib.png" LogoPolniUrl="https://dirros.openscience.si/teme/dirros/img/logo/nib.png">Nacionalni inštitut za biologijo</Organizacija>
  </Organizacije>
  <OrganizacijeVira>
  </OrganizacijeVira>
  <MetodeZbiranjaPodatkov>
  </MetodeZbiranjaPodatkov>
  <TipologijaDela ID="1.01" Koda="1.01" Naziv="Izvirni znanstveni članek" SchemaOrg="Article"></TipologijaDela>
  <OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/ARIS//P1-0237" Stevilka="P1-0237" Naslov="Raziskave obalnega morja" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="" Stevilka="" Naslov="young researchers&#039; grant" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
    <OpenAIRE ProjektID="info:eu-repo/grantAgreement/other/Friuli Venezia Giulia Region/15%2F2005" Stevilka="15/2005" Naslov="" Akronim="" Delez="0"></OpenAIRE>
  </OpenAIRE>
  <Ostalo>
    <StIrodsDatotek>0</StIrodsDatotek>
    <StDatotekPodTrajnimEmbargom>0</StDatotekPodTrajnimEmbargom>
    <StDatotekZOmejenimDostopom>0</StDatotekZOmejenimDostopom>
  </Ostalo>
</Gradivo>
