Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije

Izpis gradiva
A+ | A- | Pomoč | SLO | ENG

Naslov:Epitope mapping of major ragweed allergen Amb a 1
Avtorji:ID Zahirović, Abida (Avtor)
ID Štrukelj, Borut (Avtor)
ID Korošec, Peter, Klinika Golnik (Avtor)
ID Lunder, Mojca (Avtor)
Datoteke:.pdf PDF - Predstavitvena datoteka, prenos (607,98 KB)
MD5: DB86A19E92F768190A5619EFE6D644B0
 
URL URL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://journals.matheo.si/index.php/ACSi/article/view/4516
 
Jezik:Angleški jezik
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:Logo UKPBAG - Univerzitetna klinika za pljučne bolezni in alergijo Golnik
Povzetek:Ragweed is a prominent cause of seasonal allergies. Thus far, information on IgE-binding sites of major allergen in ragweed pollen, Amb a 1, is very limited. A powerful experimental method to gain insights on the allergen epitopes is the selection of peptides from biological libraries that bind to anti-allergen antibodies. In this work, we aimed to map IgE epitopes of Amb a 1 using epitope-mimicking short peptides % mimotopes that were affinity-selected from phage-displayed random peptide libraries. The peptides weakly aligned with the Amb a 1 primary sequence, thus suggesting that the epitopes are conformational. When the peptides were mapped onto the surface of Amb a 1 homology model, the EpiSearch analysis predicted the location of four potential epitopic sites on surface patches centred at residues K104, S110, H214, and W312. The peptides matching to the predicted epitopes bound selectively to the IgE from pool of ragweed-allergic patients% sera and therefore represent mimetics of Amb a 1 IgE epitopes. The knowledge of IgE epitopes is a prerequisite for the rational design of molecular-based approaches to diagnosis and immunotherapy of allergic diseases.
Ključne besede:allergens, ragweed allergy, Amb a 1, epitope mapping, phage display, mimotopes
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Kraj izida:Slovenija
Založnik:Slovensko kemijsko društvo
Leto izida:2019
Št. strani:str. 37-44
Številčenje:Vol. 66, no. 1
PID:20.500.12556/DiRROS-12622 Novo okno
UDK:542:616-056.43
ISSN pri članku:1580-3155
DOI:10.17344/acsi.2018.4516 Novo okno
COBISS.SI-ID:4584049 Novo okno
Avtorske pravice: (c) 2019 Abida Zahirović, Borut Štrukelj, Peter Korošec, Mojca Lunder
Opomba:Nasl. z nasl. zaslona; Opis vira z dne 13. 9. 2018;
Datum objave v DiRROS:09.11.2020
Število ogledov:1276
Število prenosov:884
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
  
Objavi na:Bookmark and Share


Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Acta chimica slovenica
Skrajšan naslov:Acta chim. slov.
Založnik:Slovensko kemijsko društvo, =Slovenian Chemical Society
ISSN:1580-3155
COBISS.SI-ID:21870085 Novo okno

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Začetek licenciranja:01.01.2019

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Povzetek:Ambrozija je pomemben vzrok sezonskih alergij. Do sedaj imamo zelo malo informacij o IgE vezavnih mestih na glavnem alergenu iz cvetnega prahu ambrozije, Amb a 1. Afinitetna selekcija peptidov iz bioloških knjižnic z uporabo specifičnih protiteles proti alergenu je uporabna laboratorijska metoda za določevanje epitopov. V tej raziskavi smo s pomočjo mimotopov, kratkih peptidov, ki posnemajo epitope, izoliranih iz bakteriofagnih knjižnic naključnih peptidov, določali IgE epitope Amb a 1. Izbrani peptidi so se le šibko ujemali s primarnim zaporedjem Amb a 1, kar je nakazovalo, da so epitopi konformacijski. Da bi jih določili, smo izdelali homologni model tridimenzionalne strukture Amb a 1, na katerega smo prilegali izbrane peptide. S pomočjo programa EpiSearch smo identificirali štiri potencialne epitope na površini alergena okoli aminokislinskih ostankov K104, S110, H214 in W312. Peptidni mimetiki predvidenih epitopov so se specifično vezali na IgE iz zmesi serumov za ambrozijo alergičnih pacientov in tako predstavljajo mimetike IgE epitopov Amb a 1. Poznavanje IgE epitopov je predpogoj za racionalno načrtovanje molekularnih pristopov v diagnostiki in imunoterapiji alergijskih bolezni.
Ključne besede:alergeni, bakteriofagne knjižnice, ambrozijske alergije, mimotopi, IgE epitopi


Nazaj